一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析
2016-06-13王海娟戴雨珂苏森森王英潘渠
王海娟戴雨珂苏森森王英潘渠
(1. 成都医学院病原生物学教研室,成都 610500;2. 成都医学院公共卫生系,成都 610500;3. 成都军区总医院肾内科,成都 610500)
一个融合魏斯氏菌隐蔽质粒的序列分析
王海娟1戴雨珂2苏森森1王英3潘渠1
(1. 成都医学院病原生物学教研室,成都 610500;2. 成都医学院公共卫生系,成都 610500;3. 成都军区总医院肾内科,成都 610500)
从融合魏斯氏菌(Weissella confusa QJ012)中发现一个隐蔽质粒(pQJ012),测序结果显示该质粒大小为1 489 bp,碱基G+C含量为42.8%。BLAST结果显示该质粒的核苷酸序列同pJY33和pKLCA的同源性分别为93%、92%。ORF1编码一个282个氨基酸残基的复制蛋白(Rep),其氨基酸序列与质粒pJY33和pKLCA的同源性分别为91%、85%。根据复制蛋白、dso和sso的序列特征,推定pQJ012的复制方式为滚环复制,是滚环复制pT181家族成员。质粒pQJ012可能构建为良好的表达载体。
融合魏斯氏菌;隐蔽质粒;序列分析;复制蛋白
魏斯氏菌(Weissella)属于乳酸菌(Lactic acid bacteria),近年来,魏斯氏菌在微生物学、医药学及发酵、工业、食品加工等方面的应用开始受到研究者的关注。魏斯氏菌作为益生菌的一员,对胃肠道健康有一定的促进作用[1]。魏斯氏菌具有β-葡糖苷酶活性[2],较好的抗真菌性[3],能促进乳杆菌(Lactobacillus)的生长[4]。魏斯氏菌产生的乳酸和各种胞外多糖,对食品的风味感官有一定的影响[5]。同时,相关魏斯氏菌新种的发现,证实其在食品的防腐方面也有着较大的应用潜能[6]。魏斯氏菌益生性质的广泛应用有待于其分子与基因水平更深层次的研究。
寻找新的质粒,构建转化率高的表达载体是促进魏斯氏菌基因工程发展的方法之一,也是魏斯氏菌走向实践应用的有效途径。……
