崔雪加得拉·吐留汗于月华陈全家申丽婕叶佳丽杨飓立陶顺倪志勇，2

（1. 新疆农业大学农学院 新疆农业大学农业生物技术重点实验室，乌鲁木齐 830052；2. 中国农业科学院棉花研究所 棉花生物学国家重点实验室，安阳 455000）

海岛棉GbHCT基因克隆及生物信息学分析

崔雪1加得拉·吐留汗1于月华1陈全家1申丽婕1叶佳丽1杨飓立1陶顺1倪志勇1，2

（1. 新疆农业大学农学院 新疆农业大学农业生物技术重点实验室，乌鲁木齐 830052；2. 中国农业科学院棉花研究所 棉花生物学国家重点实验室，安阳 455000）

克隆海岛棉木质素合成关键酶基因GbHCT全长cDNA序列，分析其在纤维不同发育时期的表达情况。根据海岛棉转录组数据中的HCT序列设计引物，采用RT-PCR技术克隆基因，通过生物信息学方法分析GbHCT的cDNA序列和氨基酸序列。通过分析转录组数据研究GbHCT在纤维不同发育时期的表达。从海岛棉中克隆了1个编码HCT的基因GbHCT，开放阅读框长度为1 311 bp，编码436个氨基酸，蛋白质分子量为48.58 kD，等电点为6.03。GbHCT氨基酸序列中含有HTLGD和DFGWG 2个保守基序。GbHCT氨基酸与陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉HCT一致性较高，与其他植物中的HCT氨基酸的一致性为55.7%-60.7%。转录组数据分析发现GbHCT在纤维不同发育阶段都有表达，在5 DPA的纤维中表达量最高，表明该基因可能参与棉花纤维的发育。

海岛棉；HCT；基因克隆；生物信息学

棉花是世界上最重要的纤维作物之一，棉纤维品质优劣直接影响纺织品的市场竞争力［1，2］。棉花为锦葵科棉属，棉属有52个种，包括4个栽培棉种、47个野生棉种。现广泛种植的陆地棉和海岛棉为异源四倍体栽培种［3］。……