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云杉矮槲寄生遗传多样性及其群体遗传结构分析

2016-05-06朱宁波李学武才让旦周吴有林田呈明

西北植物学报 2016年3期

白 云,陈 磊,朱宁波,李学武,才让旦周,吴有林,田呈明*

(1 北京林业大学 林学院,北京 100083;2 青海省森林病虫害防治检疫站,西宁 810000;3 青海省海东地区北山林场,青海海东 810500)



云杉矮槲寄生遗传多样性及其群体遗传结构分析

白云1,陈磊1,朱宁波1,李学武1,才让旦周2,吴有林3,田呈明1*

(1 北京林业大学 林学院,北京 100083;2 青海省森林病虫害防治检疫站,西宁 810000;3 青海省海东地区北山林场,青海海东 810500)

摘要:该研究采用CTAB法提取云杉矮槲寄生(Arceuthobium sichuanense)的基因组DNA,利用ITS1片段的序列信息对中国9个不同地理群体的62份云杉矮槲寄生样本的遗传多样性及群体遗传结构进行分析。结果表明:(1)62条ITS1序列共定义16个单倍型(H1~H16),表现出较低的遗传多样性水平(h=0.678 5,π=0.005 9),而群体间的遗传多样性水平则表现出较大差异(h=0~1.000 0,π=0~0.009 4);AMOVA分析显示云杉矮槲寄生群体内的遗传变异占到51.37%,群体间为48.63%。(2)Network单倍型网络分析表明,单倍型H1和H12较为古老,且所有群体对2种单倍型无共享现象;单倍型H1是广布单倍型,存在于青海和甘肃的6个群体中,单倍型H12仅在四川的2个群体中有分布。(3)基于最大似然法(ML)构建的群体聚类和中介邻接法构建的单倍型网络图均显示,四川的3个群体为独立类群,区别于青海、甘肃群体,且甘肃和青海的群体之间没有明显分化。该研究首次报道了云杉矮槲寄生遗传多样性和遗传结构,为进一步研究其进化及后续的病害防控提供了一定的参考。

关键词:云杉矮槲寄生;遗传多样性;群体遗传结构;单倍型

云杉矮槲寄生(Arceuthobiumsichuanense)是槲寄生科(Viscaceae)油杉寄生属(Arceuthobium)的多年生半寄生性种子植物,分布于中国青海、甘肃、四川和西藏等高海拔地区[1]。……

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