从叶绿体DNA角度分析云南省砂梨地方品种遗传多样性
2017-02-15齐丹曹玉芬田路明董星光张莹霍宏
齐丹+曹玉芬+田路明+董星光+张莹+霍宏亮+常耀军
摘要:探讨云南地区砂梨种質资源的遗传背景,选用4对呈现多态性的叶绿体引物,对19个原产于云南省的砂梨品种和3个对照品种的trnL-trnF、rbcL、trnS-psbC区域进行扩增。结果表明:4对引物的扩增结果合并后得到长度为3 831 bp叶绿体基因片段,含有4个单倍型(H1~H4)、14个多态性位点,其中单一突变位点11个,简约信息性位点3个,插入/缺失(InDel)1个。19份砂梨种质的单倍型(基因)多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)分别为0.602、0.000 38。合并后的片段经Tajimas D检验其D值基本未达显著水平,遵循中性模型。4个叶绿体单倍型的中介网络显示:单倍型H1与H2、H3的亲缘关系较近,而H4则与上述3个单倍型的亲缘关系较远。经叶绿体单倍型分析可知,云南砂梨地方品种的遗传多样性较为丰富。
关键词:砂梨;叶绿体DNA;遗传多样性;亲缘关系
中图分类号: S661.203.2文献标志码:
文章编号:1002-1302(2016)08-0209-03
云南省位于我国西南地区,其西北部为横断山脉区,东南部为云贵高原,地形地貌复杂,植物种质资源丰富,是中国梨的起源地之一,原产梨种质资源有川梨(Pyrus pashia Buch-Ham.)、砂梨(P.pyrifolia Nakai.)、滇梨(P.pseudopashia Yü.)、豆梨(P.calleryana Dcne.),其中砂梨是云南省地方栽培梨品种的主体,分布于云南省大部分地区,地方优良品种诸多,如宝珠梨、巍山红雪梨、富源黄皮梨、火把梨等[1]。了解地方品种的遗传多样性和亲缘关系,对揭示云南省砂梨资源的起源、保护及利用有重要意义。
DNA分子标记技术,如RAPD、AFLP、SSR、IRAP等,已经广泛应用在果树植物遗传多样性、品种鉴定、亲缘关系等研究领域[2-5]。叶绿体DNA(cpDNA)在大多数被子植物中属母系遗传,分子较小、高拷贝、结构简单、保守性强,且没有或很少经历重组,其中的非编码区域变异丰富,适于进行低分类阶元系统起源、发育和进化研究[6]。……
