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采用ChIP-chip技术分析大鼠肺成纤维细胞转分化前后全基因组蛋白H3K4三甲基化水平的改变

2016-02-14刘素娜张红义侯建勇陈慧婷郝长付

中国药理学与毒理学杂志 2016年7期

刘素娜,姚 武,暴 磊,李 娟,张红义,侯建勇,王 迪,陈慧婷,郝长付

(郑州大学公共卫生学院,河南 郑州 450001)

采用ChIP-chip技术分析大鼠肺成纤维细胞转分化前后全基因组蛋白H3K4三甲基化水平的改变

刘素娜,姚 武,暴 磊,李 娟,张红义,侯建勇,王 迪,陈慧婷,郝长付

(郑州大学公共卫生学院,河南 郑州 450001)

目的研究经二氧化硅(SiO2)染毒的肺成纤维细胞(LF)转分化前后全基因组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)三甲基化(met3)水平的改变。方法原代培养大鼠肺泡巨噬细胞(AM)和LF,采用transwell共培养,建立共培养模型,用100 mg·L-1游离SiO2粉尘染毒AM 24 h,收集LF细胞,免疫组织化学法对转分化后的LF进行表型鉴定。采用染色质免疫共沉淀联合芯片技术(ChIP-chip)对LF全基因组蛋白H3K4met3进行高通量筛选,采用染色质免疫共沉淀-实时荧光定量聚合酶联反应技术(ChIP-qPCR)验证芯片结果,采用定量逆转录聚合酶联反应技术(qRT-PCR)检测H3K4出现显著差异的mRNA表达水平。结果通过对经SiO2染毒前后LF全基因组蛋白H3K4met3水平的对比,共筛选出1815个基因存在H3K4显著性差异(Cy3/ Cy5比值>2.0或<0.5,NimbleScan V2.5软件),其中518个基因出现H3K4met3程度增高,1297个基因H3K4met3程度降低。随机挑选2个差异表达基因nfib和kpna3,以ChIP-qPCR和qRT-PCR方法验证,取得与CpG岛芯片一致的结果。结论经SiO2染毒的LF转分化前后全基因组蛋白H3K4met3水平存在显著改变。ChIP-chip技术有利于进一步揭示矽肺纤维化发生的分子机制,有助于发现新的蛋白标志物和基因干预靶点。

成纤维细胞;二氧化硅;肺泡巨噬细胞;染色质免疫共沉淀;组蛋白H3赖氨酸4;甲基化

目前,尘肺病仍是中国最严重的职业病,而矽肺是尘肺病中危害最严重的一种。长期吸入游离二氧化硅(SiO2)粉尘,导致肺成纤维细胞(lung fi⁃broblast,LF)转分化为肌成纤维细胞(myofibro⁃blast,MF)是矽肺发病重要的细胞基础[1]。细胞转分化是指分化完全的细胞在某些因素的刺激下,丢失其原有的表型特点而转变为其他类型细胞,是一种特定的生理或病理过程[2]。

LF在正常静息状态下不具有过度增殖和分泌能力,发生活化、功能改变是细胞转分化的结果[3]。M……

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