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基于基因组序列的树干毕赤酵母生理特性解析

2015-11-11刘立明史仲平

生物加工过程 2015年1期
关键词:生长

刘 婷,刘立明,史仲平

(1.江南大学 食品科学与技术国家重点实验室,江苏 无锡 214122;2.江南大学 工业生物技术教育部重点实验室,江苏 无锡 214122)

基于基因组序列的树干毕赤酵母生理特性解析

刘 婷1,2,刘立明1,史仲平2

(1.江南大学 食品科学与技术国家重点实验室,江苏 无锡 214122;2.江南大学 工业生物技术教育部重点实验室,江苏 无锡 214122)

树干毕赤酵母作为一种潜在的纤维素乙醇生产菌株,有其独特的生理优势。然而与酿酒酵母生产乙醇相比,树干毕赤酵母生产纤维素乙醇还存在着诸多阻碍。为了从细胞整体水平进一步解析树干毕赤酵母的生理代谢特征,基于树干毕赤酵母的全基因组序列,利用生物信息学的分析算法,分别解析了树干毕赤酵母与酿酒酵母代谢网络的异同;利用流量平衡分析(FBA)验证了C源生长表型;预测了158个生长必需反应;鉴定了364个转录因子并对重要调控蛋白的功能进行了分析。

树干毕赤酵母;基因组序列;生理特性;流量平衡分析

传统的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)由于具有较高的乙醇产率、成熟的分子改造手段等一系列优点而成为乙醇工业化生产的最佳模式微生物[1]。乙醇生产的另一种优势菌株是运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis),其最高乙醇得率可达理论得率的97%,且对乙醇的耐受性高达120 g/L[2]。但对于纤维素乙醇的生产,上述2种微生物均存在的一个难以克服的缺陷,即不能天然发酵戊糖(半纤维素的主要成分)。尽管大量代谢工程改造工作以尝试导入木糖代谢途径,但是效果却不够理想[3]。……

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