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人长链非编码RNA基因SPRY4-IT1对肺癌细胞A549侵袭和迁移能力的影响

2015-09-06柴松安文婷郭丽丽姜乐高志嵩李书军

中国肺癌杂志 2015年8期
关键词:肺癌实验

柴松 安文婷 郭丽丽 姜乐 高志嵩 李书军

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,在人类全基因组中有20万-40万种不同的lnc RNA。研究[1]表明lnc RNA可以通过多种方式影响编码基因的表达,在肿瘤的发生发展过程中起调控作用。SPRY4内含子转录本1(SPRY4 intronic transcript 1, SPRY4-IT1)(基因号AK024556)是转录自SPRY4基因的第二个内含子的长度为687个核苷酸的未剪接的、多聚腺苷酸化的转录产物,最初在脂肪组织中得以鉴定,且过表达SPRY4-IT1在黑色素瘤中具有促进细胞生长、迁移和侵袭的作用[2],然而其在肺癌细胞中的作用尚未报道。本研究拟探讨SPRY4-IT1对肺癌细胞A549侵袭和迁移能力的影响,并初步探索可能的作用机制。

1 材料和方法

1.1 材料 人肺癌细胞系A549、95C、95D、Calu-3、H125、H1299、H1975、SPC-A1由河北医科大学第二医院肿瘤中心提供;抗基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase, MMP)-2抗体、抗MMP-9抗体均购自武汉博士德生物有限公司;Transwell(8 μm孔径)小室及Matrigel胶购自北京乐博生物科技有限公司,实验中所用引物由广州锐博生物有限公司设计并合成,检测SPRY4-IT1在肺癌A549细胞中的表达,RT-PCR上游引物为5'-AGCCACATAAATTCAGCAGA-3',下游引物为5'-CGATGTAGTAGGATTCCTTT-CA-3',GAPDH上游引物为: 5'-GACTCATGACCACAGTCCATGC-3',GAPDH下游引物为: 5'-AGAGGCA-GGGATGATGTTCTG-3'。

1.2 基因全长序列克隆 根据GenBank数据库SPRY4-IT1标准序列NR-002196.1设计引物,上游引物5'-TAAGCTTGTAGAGATGGGGGTTTCATCCTGTTGG-3',下游引物5'-ACTCGAGAAAGACTCCCTTTCCTTAAGCAGATTCAC-3’,循环条件:93oC预变性1 min,93oC变性30 s,65oC退火30 s,72oC延伸2 min,25个循环,72oC终末延伸5 min,产物用1%琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物并进行产物纯化回收,将产物连接T载体后,转化DH5α感受态细胞,通过蓝白斑筛选,挑取白色克隆,扩增后进行酶切鉴定,同时送测序分析证实扩增片段的正确性。

1.3 构建真核表达载体 双酶切pcDNA3.1载体和插入正确片段的T质粒,分别纯化回收目的片段。……

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