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15个基因座复合扩增体系的建立及新疆维吾尔族遗传多态性

2015-08-27刘海渤廖琴香

法医学杂志 2015年1期
关键词:新疆体系检测

桂 娟 ,刘海渤 ,廖琴香 ,徐 旭 ,鲁 涤 ,袁 丽

(1.司法文明协同创新中心,北京 100088;2.中国政法大学 证据科学教育部重点实验室,北京 100088;3.兵团公安局物证鉴定中心,新疆 乌鲁木齐 830000)

短串联重复序列(STR)是以2~6 bp核心序列为重复单位的基因片段结构,其长度一般在100~500bp,具有多态性好、易于扩增、易自动化检测、快捷等优点,在群体遗传学研究、疾病相关性研究、法医学个体识别和亲权鉴定中具有重要的应用价值[1-2]。本研究应用多重聚合酶链式反应(PCR)和五色荧光自动化检测技术建立15个基因座荧光复合扩增体系,并对新疆维吾尔族群体进行遗传多态性分析。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 样本

采集新疆维吾尔族无关健康个体血样299份(均经知情同意)。种属特异性研究选取猩猩、蜘蛛猴、黑猩猩、黑白猕猴、大猩猩、黑冠猕猴、雪貂等DNA(由公安部物证鉴定中心提供),以及兔、羊、猪、犬、猫、鸭、鸡、牛、鲫鱼等常见动物肌肉样本。同一性研究采集志愿者的血液、口腔拭子、带毛囊的毛发样本。系统灵敏度研究采用9947A样本。

1.1.2 仪器和试剂

9700型PCR扩增仪(美国AB公司),3130遗传分析仪(美国AB公司),-86℃超低温冰箱(美国Thermo公司),超纯水仪(美国Millpore公司)。

PCR反应缓冲液、ILS500内标(公安部物证鉴定中心),去离子甲酰胺、POP-4胶(美国AB公司),Chelex-100(美国 Bio-RAD 公司),0.5 ng/μL 9947A(美国Promega公司),引物委托上海生工生物有限公司合成,等位基因测序由北京诺赛生物公司完成。

1.2 方法

1.2.1 基因座的筛选

经文献筛选及前期遗传学调查,确定13个常染色体 STR 基因座(D4S2366、D9S925、D3S1744、D11S2368、D15S659、D17S1290、D7S3048、GATA198B05、D14S608、D20S470、D18S535、D19S253、D10S1435)、1 个 X 染色体基因座DXS7132和1个性别基因座Amelogenin。

1.2.2 复合扩增体……

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