2型糖尿病与胰腺癌表达谱的相关分析

2014-12-02孙丽岩

山东医药 2014年9期

孙丽岩，李珺，王泳

(中国人民武装警察部队北京市总队第二医院，北京100037)

糖尿病与癌症都是目前全球性的高发疾病，都有急剧上升趋势。流行病学研究表明，2型糖尿病患者患癌症的概率高于正常人［1～4］。统计学研究表明，糖尿病患者发生胰腺癌的比例高于正常健康人。但目前对胰腺癌与糖尿病的因果关系还存在一些争议。为探讨2型糖尿病与胰腺癌之间的关系，我们进行了相关研究。现报告如下。

1 材料与方法

1.1 材料从基因表达汇编(GEO)数据库中下载2型糖尿病患者及其对照的基因表达谱数据(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13760)［5］，以及胰腺癌患者及其对照的基因表达谱数据(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE16515)［6］。其中2型糖尿病患者10例，对照者11例，平台为affymatrix的HG-U133A_2。胰腺癌患者10例，对照者10例，平台为Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0。

1.2 方法

1.2.1 分析方法使用R语言affy包对基因表达谱数据进行标准化，用Limma包筛选2型糖尿病患者与其对照之间的差异基因，以及胰腺癌与其对照之间的差异基因。将差异基因提交到DAVID数据库(david.abcc.ncifcrf.gov/home.jsp)分析全基因及代谢途径(KEGG)通路。KEGG数据库中包含代谢网络、细胞过程及人类疾病等通路信息。DAVID数据库提供了很多注释工具，这些工具可以将一个基因列表富集到特定的通路中。将2型糖尿病及其对照的差异基因提交到DAVID在线网站上，分析这些基因会在哪些KEGG通路上富集。随后，我们将胰腺癌及其对照的差异基因进行了同样分析。得到这些通路后，对二者的KEGG通路进行比较。

1.2.2 统计学方法采用 R语言统计软件，P≤0.05为有统计学差异。