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中国恒河猴肠道菌群特征揭示

2013-09-13赵娜刘社兰路纪琪何宏轩赵宝华

生物技术通报 2013年7期

赵娜 刘社兰 路纪琪 何宏轩 赵宝华

人类和灵长类动物在形态、生理、基因和行为上的近似使得灵长类成为研究人类疾病的模型,其中恒河猴(Rhesus Macaques)是被研究得最清楚的旧世界猴,被广泛应用于生命科学研究领域。在恒河猴养殖业,尤其是处于食性转换期和特殊生理时期的恒河猴个体中,由于病毒和肠道病原体传染造成的疾病严重威胁恒河猴的健康。传统研究肠道菌群特点的方法主要是选择性培养,但是由于肠道中大多数细菌不能用传统研究方法进行培养、分离和鉴定[1,2],因此人们对恒河猴肠道及粪样微生物的变化规律知之甚少。

DGGE技术可以快速检测传统条件不能培养的细菌,发现新的微生物,作为微生物分子生态学研究的重要手段,被广泛地应用于微生物群落多样性和动态分析[3]。16S rRNA基因DGGE图谱条带数目可以反映微生物菌群的多样性,条带染色后的亮度可以相应反映细菌在群体中的丰度。对PCR-DGGE分离得到的条带进行克隆测序或杂交可以进一步准确鉴定细菌的种属[4,5]。与普通PCR相比,实时荧光检测技术(Real-time PCR)可以对整个PCR过程中产物的扩增过程加以监测,能够直观地反映PCR模板浓度与扩增产物含量之间的关系,具有高度准确性,目前,这项技术已经被广泛用于动物肠道菌群检测及环境微生态的检测研究[6]。

McKenna等[7]运用焦磷酸测序技术研究了慢病毒感染及慢性结肠炎的恒河猴的肠道微生态特点,并简单与健康恒河猴进行比较,但是迄今为止没有系统关于不同年龄段健康恒河猴个体肠道主要菌群多样性及其特点的报道。……

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