王丽凤 张家超 马 晨 孙志宏 付维来 张和平＊

（1.乳品生物技术与工程教育部重点实验室，内蒙古农业大学食品科学与工程学院，呼和浩特010018；2.饲用微生物工程国家重点实验室（筹），北京100192）

微生物及其复杂的微生物群落在其生存环境的大部分生化转化中承担着巨大责任。事实上，这些微生物定植于宿主每一个暴露于外界的身体表面，包括皮肤、口腔、呼吸道、泌尿生殖道和胃肠道。在这些身体部位中胃肠道是最密集的微生物定植器官［1］。这些存活于胃肠道的复杂微生物群落被认为是肠道微生物。胃肠道微生物在营养、代谢、生理和免疫过程中起重要作用，能从不可消化多糖类饲料，如抗性淀粉和纤维物质中摄取能量来发挥重要的作用。这些代谢活性也导致了重要营养物质的产生，诸如短链脂肪酸（short chain fatty acids，SCFAs）、维生素和氨基酸［2］。此外，肠道微生物通过定植抵抗和抗菌化合物产生机制参与病原菌防御抵抗。肠道菌群还参与胃肠感觉和蠕动功能的发育、成熟和持续，肠道屏障和免疫系统［3］。

最近研究揭示，脊椎动物胃肠道寄居着复杂的微生物，这些微生物对脊椎动物健康和疾病的贡献引起了人们对肠道微生物菌群如何构建以及它们如何影响宿主健康方面的强烈兴趣［4］。虽然脊椎动物胃肠道寄居着大量微生物，但目前关于微生物菌群组成和功能方面的信息主要来源于哺乳动物。从解剖学角度发现，不同种类的哺乳动物肠道微生物菌群组成与宿主饲粮、亲缘关系间存在密切相关性［5］。……