微卫星在酿酒酵母研究中的应用
2013-08-07刘延琳
食品科学 2013年5期
关键词:酵母菌
冯 敏,刘延琳*
(西北农林科技大学葡萄酒学院,陕西 杨凌 712100)
微卫星DNA由短的核心序列(一般1~6bp)串联重复构成,故也被称为简单重复序列(simple sequence repeats, SSRs),如(CA)n、(GTG)n等,其中双核苷酸重复最为常见,其次为3个核苷酸或者4个核苷酸的重复。微卫星在真核生物基因组中广泛存在且均匀分布,在酵母中,每100kb就有1.8个微卫星位点[1-2]。自酿酒酵母全基因组序列公布以后,科学家开始构建搜索酿酒酵母微卫星序列的方法,并取得显著成果[2-5]。因微卫星在真核生物基因组中种类多、分布广,呈选择中性和共显性遗传,多态性丰富且在种内高度保守,一些学者已将微卫星位点的组合分析用于酿酒酵母分型和遗传多样性研究,但尚未达到该技术的最大分辨率[6-9]。鉴于此,Legras等[10-11]对41个微卫星位点的多态信息进行评估和筛选,得到6个稳定的高变异微卫星位点,而这6个位点丰富的多态性也在随后其他学者的研究中得到认可。近年来,随着微卫星序列搜索技术、引物开发技术和检测分析技术的不断完善,其在酿酒酵母相关研究中得到了更为广泛的应用,并呈现出广阔的发展前景。
1 微卫星的应用原理
1.1 微卫星位点多态性形成机理
微卫星DNA因其核心序列重复次数不同及重复程度不同形成了每个座位的多态性[12],而重复次数的差异是DNA复制和修复过程中滑动错配或减数分裂过程中非姐妹染色单体的不等交换所致[13-14]。而微卫星的进化则是通过链滑移而非重组[15]。此外,Messier等[16]认为微卫星序列越长,其多态性也越丰富,其原因是在DNA复制或者修复时,滑动链与互补链碱基错配,如果错配不能修复,将会导致一个或几个重复单位的插入或缺失。……
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