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一株产淀粉酶枯草芽孢杆菌16S rDNA的克隆及序列分析

2013-06-07李元召孙俊良李东霄张永帅

关键词:分析

李元召,孙俊良,李东霄,张永帅

(1.河南科技学院,河南新乡453003;2.酶制剂工程研究所,河南新乡453003)

一株产淀粉酶枯草芽孢杆菌16S rDNA的克隆及序列分析

李元召1,孙俊良1,李东霄1,张永帅2

(1.河南科技学院,河南新乡453003;2.酶制剂工程研究所,河南新乡453003)

对实验室保存的一株产α-淀粉酶的枯草芽孢杆菌的16S rDNA区进行克隆及序列分析.采用PCR克隆方法,对其菌株的16S rDNA区进行序列扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,获得一个大小约为1 300 bp的特异性扩增条带,随后将测序结果用GeneBank数据库中的BLAST软件与获取的已知枯草芽孢杆菌的16S rDNA序列进行序列比对分析.结果表明:该枯草芽孢杆菌与枯草芽孢杆菌FZB42具有相似的序列,相似性为97%.根据上述分析结果可判定2种枯草芽孢杆菌为同属细菌.

枯草芽孢杆菌;16SrDNA;序列扩增;基因测序

淀粉酶是一类被广泛应用于粮食加工、食品工业、酿造、发酵、纺织品工业和医药行业等众多领域的酶制剂.淀粉酶可由微生物发酵产生,也可从植物和动物中提取,目前工业生产上都以微生物发酵法进行大规模生产淀粉酶[1].枯草芽孢杆菌的定性和分类主要依赖于形态和生理特征.然而,这些特征所表现的均是表型性状,难以反映种间亲缘关系,因此它们所反映的遗传基础是有限的.随着DNA序列分析技术的日趋成熟和简易化,现代细菌学更倾向于细菌的基因型特征结合表型特征进行分类,细菌基因组中编码核糖体的基因包括5S rDNAs、16S rDNAs和23S rDNAs3种,目前公认的方法是依据细菌……

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