耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化的研究
2012-01-09尹红英王红兵
尹红英 王红兵
基因的突变、缺失是抑癌基因失活的主要途径,近年来研究表明启动子区域CpG岛的甲基化是导致抑癌基因失活的又一重要途径[1]。乳腺癌易感基因 ( breast cancer susceptibility gene,BRCA1)是参与多种肿瘤发生的抑癌基因[2],研究表明其参与细胞周期调控、DNA损伤修复、基因的转录调节、细胞凋亡和泛素化等重要的细胞活动[3]。本研究采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株BRCA1基因启动子CpG岛甲基化的状态,以探讨A549/Taxol细胞对紫杉醇的耐药机制。
1 材料与方法
1.1 主要试剂
细胞基因组DNA提取试剂盒购自北京TIANGEN公司;BRCA1基因甲基化检测试剂盒为GENMED公司产品;PCR试剂盒为 Promega公司产品;引物由上海生物工程技术有限公司合成;耐紫杉醇人肺腺癌 A549细胞株(A549/Taxol)购自南京凯基生物科技发展有限公司。
1.2 方法
1.2.1 A549/Taxol细胞培养 取A549/Taxol细胞,用含10%胎牛血清的RPMI 1640培养液,于37℃含5% CO2培养箱中培养。
1.2.2 甲基化特异性PCR(MSP) 取对数期生长的A549/Taxol细胞,参照基因组DNA提取试剂盒说明书提取基因组DNA,在UV 3 000紫外分光光度仪上测定吸光度值鉴定DNA纯度,OD260/OD280比值均在1.8~2.0之间。取2 μg基因组DNA,参照BRCA1基因甲基化检测试剂盒说明书进行甲基化修饰。分别取修饰DNA及未修饰DNA 100 ng进行MSP反应。BRCA1基因甲基化引物:M,F:5′- TCGTGGTAACGGAAAAGCGC-3′,R:5′- AAATCTCAACGAACTCACGCCG-3′。非甲基化引物:U,F:5′- TTGGTTTTTGTGGTAATGGAAAAGTGT-3′,R:5′-CAAAAAATCTCAACAAAC-TCACACCA-3′。反应体系按照PCR试剂盒推荐量25 μl体系进行:PCR混合液12.5 μl,上下游引物各1 μl,模板1 μl,无核酶水9.5 μl。MSP循环条件:95 ℃预变性12 min,95 ℃变性40 s,甲基化引物60℃退火45 s,非甲基化引物在57 ℃退火45 s,72 ℃延伸60 s,循环扩增35次,72℃ 10 min。应用Gene Amp PCR System 2400扩增仪(美国PE公司)。甲基化特异性引物(M)扩增的目的片段为75 bp,非甲基化特异性引物(U)扩增的目的片段为86 bp。……
