退火温度对聚合酶链式反应焓值的影响
2011-12-28周国燕李红卫
周国燕 蓝 浩 李红卫
(上海理工大学生物系统热科学研究所,上海 200093)
退火温度对聚合酶链式反应焓值的影响
周国燕 蓝 浩 李红卫
(上海理工大学生物系统热科学研究所,上海 200093)
在聚合酶链式反应(PCR)热循环中,退火温度的选取至关重要,该因素的稍微变化对PCR扩增会产生很大的影响,导致整个PCR的热现象变化。通过差示扫描量技术(DSC)研究HBV在不同退火温度时焓值随循环数的变化。结果表明:PCR扩增在变性阶段吸热,在退火和延伸阶段放热,每一个PCR循环呈现放热效应,同时退火温度高导致平台期的前移和焓值的降低,53℃退火最佳。
聚合酶链式反应;焓值;差示扫描热量技术;退火温度;循环数
聚合酶链式反应 (polymerase chain reaction,简 称PCR),是一种体外快速扩增特异 NA片段技术[1],由Kary.B.Mullis等于1985年在PE-Cetus公司发明并命名。PCR虽然在设计上十分简单,但实际上是个非常复杂的生化反应过程,目前为止还是一种半经验性的技术,此外PCR的高度敏感性导致任何因素的微小变化都会很大程度影响检测结果,如假阴、假阳性问题和非特异扩增[2]。故探索研究PCR的影响因素及控制方法很有必要。
PCR热循环过程各阶段温度的选取对其扩增结果的影响很大,其中退火温度的高低不仅决定着反应的特异性,也影响着反应的扩增效率。现有的研究[3,4]表明:退火过程首先是引物和模板形成复合物,其次形成引物-模板-酶三倍体复合物,该过程伴随着化学键的不断生成和断裂,引起吸放热现象的产生。Conceicao等[5]用等温滴定法研究了模板引导DNA复制过程中的碱基插入和延伸时热动力学变化,结果表明酶促催化的碱基插入和DNA延伸过程是个放热过程。……
