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粪便Alu序列的检测在胰腺癌诊断中的价值

2011-11-22任艳高军王小玮刘建强顾俊骏金晶龚燕芳李兆申

中华胰腺病杂志 2011年6期
关键词:检测方法

任艳 高军 王小玮 刘建强 顾俊骏 金晶 龚燕芳 李兆申

·论著·

粪便Alu序列的检测在胰腺癌诊断中的价值

任艳 高军 王小玮 刘建强 顾俊骏 金晶 龚燕芳 李兆申

目的检测胰腺癌患者粪便Alu序列表达量,探讨其对胰腺癌的诊断价值。方法收集41例胰腺癌、27例慢性胰腺炎及23例健康者的粪便样本,采用酚-氯仿方法抽提粪便中基因组DNA,应用实时定量PCR方法检测Alu重复序列的表达量。结果胰腺癌、慢性胰腺炎、正常健康者粪便Alu重复序列表达量分别为(5.17±0.99)、(3.79±0.94)、(0.28±0.35)ng/g,三组间差异有统计学意义(P值均<0.05)。通过接受者操作特征(ROC)曲线分析,胰腺癌的曲线下面积为74.8%,95%可信度为0.661~0.835,诊断胰腺癌的敏感性为75.6%,特异性为67.1%。结论胰腺癌患者粪便Alu序列表达量显著增加,对胰腺癌的诊断可能有一定价值。

胰腺肿瘤; Alu序列; 诊断; 实时定量PCR; 粪便

Alu重复序列是人类基因组中一族散布的、长度大约为300 bp的中等重复序列。它是短分散重复序列(short interspersed elements,SINEs,≤500 bp)中最大的一个家族,约占基因组的5%~10%,以平均间隔4 kb随机分散于整个基因组中。Alu序列插入到功能重要的基因区或其他Alu依赖性的基因功能改变区会导致多种遗传性疾病,并且可能和肿瘤的发生相关[1]。本研究旨在观察Alu序列表达与胰腺癌发生、发展的关系,探讨其临床意义。

材料与方法

一、研究对象

选取长海医院2007年9月至2010年5月住院患者68例,其中胰腺癌患者41例,慢性胰腺炎患者27例。以正常健康者23例作为对照。患者的一般情况见表1。

表1 各组的一般临床资料

二、粪便收集方法及DNA提取

标本收集于冻存管后即置于冰盒中,在6 h内转移至-80℃冰箱保存。从冻存管中称取200 mg粪便,先加入淀粉及TEN预处理,采用酚-氯仿方法抽提DNA,再采用qiagen纯化试剂盒纯化DNA。使用NanoDrop (ND-1000, USA) 进行DNA浓度检测和纯度鉴定,置-80℃保存。……

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