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荧光PCR快速检测艰难梭菌

2011-08-15吴劲松浙江省湖州市南浔人民医院检验科湖州313000

浙江中西医结合杂志 2011年5期
关键词:检测方法

吴劲松 浙江省湖州市南浔人民医院检验科 湖州 313000

艰难梭菌(clostridium difficile,CD)又称难辨梭状芽孢杆菌,是一种厌氧革兰染色阳性芽孢杆菌,广泛分布于自然环境及动物和人的粪便中,主要通过粪-口途径传播[1-2]。艰难梭菌是引起医源性腹泻的重要病原菌,与大量抗生素使用有关,其感染典型表现是伪膜性肠炎[3-4]。目前全球特别是欧洲和北美艰难梭菌感染的流行暴发迅速增多,严重病例数、复发率和病死率均明显上升,耐药菌株也在增多,给该病的临床诊断和治疗提出新的挑战[5],因此临床实验室对其快速而准确的识别、鉴定具有重要意义。笔者采用实时荧光PCR方法对艰难梭菌进行快速检测鉴定。

1 材料与方法

1.1 菌 株 艰难梭菌标准菌株(ATCC9689)及其它引起腹泻致病菌如福氏志贺菌ATCC51311,空肠弯曲菌ATCC33560,产单核李斯特菌ATCC7644,霍乱弧菌ATCC16026,肠出血性大肠埃希菌O157:H7 ATCC43889,沙门菌 ATCC50041/ATCC14028,副溶血性弧菌ATCC20506。均购于中国微生物菌种库。

1.2 粪便标本 278例粪便标本均来自我院2010年1月—2010年12月住院腹泻患者,所有标本采集后均保存于4℃,并在4h内完成检测。

1.3 艰难梭菌毒素检测 采用法国生物梅里埃公司的VIDAS难辨梭菌毒素检测试剂对上述粪便标本艰难梭菌感染情况进行分析。

1.4 基因组DNA提取 菌株基因组DNA提取采用Promega公司WizardGenomic DNA Purification Kit试剂盒,粪便基因组提取采用QIAGEN公司的QIAamp DNA stool Mini Kit试剂盒,按照操作说明进行。

1.5 荧光定量PCR 根据艰难梭菌TcdB基因序列采用Primer Express3.0软件(ABI)设计特异性引物和探针,上游引物:5’-GAAAGTCCAAGTTTACGCTCAAT-3’;下游引物:5’-GCTGCACCTAAACTTACACCA-3’;荧光探针:5’-FAM-ACAGATGCAGCC AAAGTTGTTGAATT-TAMRA-3’。按照以下体系配制反应液:5.0μL10×PCR buffer,7.0μL 25mM Mg2+,4.0μL 2.5mM dNTP,10μM 上下游引物各 2.0μL,10μM 荧光探针 0.5μL,5U/μL Taq 酶 1.0μL,模板DNA 5.0μL,双蒸水补足 50μL;……

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