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高质量加工番茄基因组DNA提取方法的改进

2011-06-08楠,谢

湖南农业科学 2011年15期

张 楠,谢 放

(兰州交通大学化学与生物工程学院,甘肃 兰州 730070)

目前选育高品质植物品种主要采用的是分子标记辅助育种方法,因而怎样获得高质量的基因组DNA用于后续的分子标记将显得非常关键。番茄中含有较多的多糖和其他次生代谢产物(酚、酯、萜、色素等)[1],这给高质量的DNA提取带来较多的困难。尤其是多糖、色素、蛋白质成分是影响DNA纯度最常见的问题。如何做到在去除污染物又能相对保持高的产量的同时,对大批量的模板进行提取,一直是像番茄这类含多糖、色素和盐类物质较多的植物所探讨的问题。

在加工番茄分子标记辅助育种时,多采用CTAB法[2]、SDS法及DNA试剂盒[3-4]等提取番茄DNA,效果均不太理想。通过试验比较多种提取方法,得到一种适用于提取大批量加工番茄DNA的方法——改进CTAB法。通过此法克服了番茄中富含多糖、蛋白质、酚和色素的影响,所得DNA通过凝胶电泳和分子标记均获得了满意的结果,可以将此方法在富含上述物质的植物中推广使用。

1 材料与方法

1.1 试验材料

加工番茄叶片于2010年7月采摘于兰州交通大学科技园试验田。将采摘的幼嫩叶片和老叶片分别装入塑料袋置于冰盒中带回实验室,置于-20℃备用。

1.2 药品与试剂

引物序列:随机引物S636(GGGATATCGC),ISSR 引物 855(ACACACACACACACACYT)上述引物由上海生工生物工程公司合成。

CTAB 提取液:含 2%CTAB,1.4 mol/L NaCl,0.2%β-巯基乙醇,20 mmol/L EDTA,100 mmol/L Tris-HCL pH 值 8.0,PVP,10 mg/mL RNase;TE 缓冲液:含 10 mmol/L Tris-HC1,l mmol/L EDTA(pH 8.0);饱和酚∶氯仿∶异戊醇(V∶V∶V)=25∶24∶1,氯仿︰异戊醇(V∶V)=24∶1;50×TAE 缓冲液:1 L 缓冲液中含有242.0 g Tris碱,57.1 mL冰乙酸,200 mL 0.5 mol/L EDTA,pH 值 8.0。

1.3 仪器

TGL-20M高速冷冻离心机(湖南湘仪);紫外分析仪(北京六一仪器厂);……

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