小鼠不同细胞间组蛋白修饰变化对MafA基因转录表达的影响
2011-02-16李明岳鲍世韵刘嘉林郑锦锋林宝行余小舫
李明岳,鲍世韵,刘嘉林,郑锦锋,林宝行,余小舫
(暨南大学第二临床医学深圳市人民院,深圳 518020)
组蛋白在翻译后的修饰中会发生改变,从而提供一种识别的标志,为其它蛋白与DNA的结合产生协同或拮抗效应,是一种动态转录调控成分[1]。染色质免疫共沉淀-实时定量PCR法(chromatin immunoprecipitation-real time quantitative PCR methods,CHIP-PCR)技术可以检测特定DNA序列染色质的结构,能够充分反映生理条件下的DNA与蛋白质相互作用的真实情况[2]。MafA基因又称亮氨酸拉链蛋白Maf家族A(v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene family protein A,MafA),是一个关键的基因特异性表达的调节器,对于胰腺生长和β细胞的分化及β细胞正常功能的维持起重要作用[3]。本研究采用CHIP-PCR技术比较小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mES)、NIH小鼠成纤维细胞(NIH 3T3)和小鼠胰岛素瘤β细胞(NIT-1)之间MafA基因转录起始区的组蛋白修饰变化,以管家基因MLH1为对照,探讨组蛋白修饰对MafA基因转录表达的作用。
1 材料和方法
1.1 主要材料和仪器
(1)129/J小鼠胚胎干细胞(40 XY)和γ射线照射处理的第3代昆明小鼠胚胎成纤维细胞由赛业(广州)生物科技有限公司提供。小鼠成纤维细胞株NIH3T3细胞和小鼠β细胞株NIT-1细胞由中山医科大学动物实验中心细胞库提供,上述两细胞均来自美国ATCC细胞库;(2)组蛋白H3K4三甲基化(histone 3 lysine 4 trimethylation,H3K4m3)抗体(Abcam)、组蛋白H3K9三甲基化(histone 3 lysine 9 trimethylation,H3K9m3)抗体(Abcam)、组蛋白H3乙酰化抗体(Upstate)、抗小鼠Ig-G磁珠(BioLabs);(3)超声仪器Bioruptor(Diagenode)、Nanodrop(Agilent)、TaKaRa PCR Thermal Cycler(宝生生物工程有限公司)、ABI 7700 Realtime PCR仪(ABI);(4)引物设计软件:Primer 5.0。
1.2 细胞的准备
1.2.1 mES细胞的培养:预先准备由明胶包被的六孔板培养器皿,饲养层细胞是经γ射线照射处理的第3代昆明小鼠胚胎成纤维细胞。加入解冻后的mES细胞悬液和129/J小鼠胚胎干细胞完全培养基,在37℃、5%CO2、80%相对湿度的培养箱中培养。……
