B细胞BCRCDR3受体库的高通量测序分析概况①
2011-02-12王小妹综述姚新生审校
王小妹 王 鹏 综述 姚新生 审校
(遵义医学院免疫学教研室贵州省免疫学研究生教育创新基地,遵义563003)
B细胞是介导机体体液免疫应答的主要细胞群,其识别、结合抗原主要依赖互补决定区(CDR),它决定着抗体的特异性,而互补决定区3(CDR3)比CDR1、CDR2更具多样性[1],通过观察机体 B细胞BCRCDR3受体库的多样性、重叠率的大小、CDR3区的基因/氨基酸组成特征、各亚家族的偏向取用等,可以观察生理及病理状态下机体免疫的相关情况。高通量测序能对一个物种的转录组和基因组进行全貌、细致的分析,目前在国外已开展并应用于B细胞BCRCDR3受体库测序。
1 B细胞BCRCDR3受体库概述
机体体液免疫应答主要由B细胞介导,其通过产生特异性抗体来应答抗原,对机体起重要保护作用。B细胞识别抗原主要依赖BCR,BCR是由两条重链(H)和两条轻链(κ或λ)组成的四聚体,其可变区和恒定区分别由不同染色体上的多个不连续基因片段重排所编码。人的κ链(2p11.2)和λ链(22q11.2)由“Vn-Jn-C”基因重排形成,H 链(14q32.33)由“Vn-Dn-Jn-Cn”基因重排形成,其可变区包含三个高变区,分别为 :CDR1、CDR2、CDR3,而决定 B 细胞识别抗原肽的关键部位是最具多样性的重链CDR3区,其由“IGHV(51个功能性基因片段)末端-IGHD(23个功能性基因片段)--IGHJ前端(6个功能性基因片段)”(http://www.imgt.org/IMGT-GENE-DB/GENElect?livret=0)基因重排及“V—D”和“D—J”连接时中间插入或剪接的核苷酸序列组成,类型转换和体细胞高频突变都能促成其多样性形成[2](单个人由于重链、轻链本身的多样性及重、轻链配对组合的多样性至少能形成1011种以上B细胞受体)[3]。由于其惊人的多样性,正常机体几乎能对所有侵入机体的异物产生应答[4]。……
