高分辨率熔解曲线分析:一种新的用于遗传病基因突变筛查的技术
2011-02-11李东至
中国产前诊断杂志(电子版) 2011年2期
关键词:检测
李东至
(广州市妇女儿童医疗中心 产前诊断中心,广东 广州 510623)
目前,DNA碱基变异如突变或单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的检测方法有2种:一是针对特定的位点合成序列特异性探针,如Taqman探针法、位点特异寡核苷酸分析、反向斑点杂交及基因芯片等,用于检测已知突变;二是以核酸的物理性质为基础的检测方法,如变性-高效液相层析、单链构象多态性、变性梯度凝胶电泳、温度梯度凝胶电泳及构象敏感凝胶电泳等,此类方法可用作突变筛查,但无法明确突变性质。这2种方法在应用上有其局限性,如成本高、操作繁琐、耗时、以及相对低通量。DNA测序是突变/SNP检测的金标准,但不适于大规模突变筛查和流行病学研究。2002年犹他大学和爱德华科技公司合作开发出突变/SNP检测分析的一项新技术—高分辨率熔解曲线分析(high resolution melting,HRM)[1]。这种技术不受突变碱基位点与类型的限制,可同时对扩增片段进行未知突变扫描和已知突变的基因分型。因其操作简便、快速、高通量、低成本和真正实现了闭管操作而受到普遍的关注,成为近年来兴起的一种高通量突变扫描和基因分型技术。
1 HRM原理
通过PCR反应扩增出目的基因的双链DNA片段,向反应产物中加入荧光染料,这种染料只结合双链DNA而不结合单链DNA。然后通过加热物理变性,在升温的过程中DNA双链会逐渐打开,这样结合的荧光染料会越来越少。如果相机连续动态拍摄解链过程,并将接收到的逐渐减弱的荧光信号通过计算机软件转换成一条曲线,这条曲线就是熔解曲线。……
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