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微小RNA与肿瘤诊断

2010-08-15王秀宏

菏泽医学专科学校学报 2010年4期
关键词:癌基因细胞株靶向

王秀宏

(天津市中医药研究院附属医院,天津 武清 301700)

微小RNA(miRNA或miR)是近几年发现的一类长度约22个核苷酸的内源性非编码RNA,通过与靶mRNA互补结合,在转录后水平调节靶基因的表达是细胞内基因表达的调控机制之一。迄今为止,已在哺乳动物细胞中鉴定出800多种miRNA,它们在细胞生长、分化、增殖、凋亡及体内稳态等多种生理过程中发挥重要调节作用[1-2]。miRNA的异常表达与各种类型恶性肿瘤(包括血液源性恶性肿瘤)的发生密切相关,在不同类型肿瘤有特征性的表达。大约50%的miRNA定位于基因组与肿瘤相关的脆性位点(FRA)上,这些miRNA所起的作用类似于抑癌基因和癌基因[3]。深入理解miRNA在肿瘤中的作用,对其早期诊断及建立有效的miRNA靶向治疗具有重要意义。

1 miRNA的生成及作用机制

目前人类miRNA的生物合成已得到较为详尽的阐述。首先,在细胞核中,miRNA基因由RNA聚合酶II或聚合酶[3]转录成较长的(100~1000个核苷酸)含有5’7-甲基鸟苷帽子及3’polyA尾的初级转录物(Pri-miRNA);而后,Pri-miRNA被RNaseIII型核酸内切酶Drosha及其辅酶DGCR8加工成约70个核苷酸的茎环发卡结构前体(Pre-miRNA),随后由GTP依赖的转运蛋白Exportin-5运至细胞质之中。细胞质中的前体被另一种RNaseIII型核酸内切酶Dicer及其辅助因子TRBP/PACT剪切掉环状结构,形成约22个核苷酸的双链miRNA[4]。其中的一条链在Argonautes蛋白引导下进入RNA诱导的沉默复合体(RISC),成为成熟miRNA,同时另一条链降解。

成熟miRNA通过与特异的靶mRNA3’UTR(3’非翻译区)核酸序列互补结合,对靶基因产生调控。其作用方式有两种:靶向降解mRNA和抑制靶mRNA翻译,到底产生哪种作用主要取决于miRNA与靶mRNA互补作用[5]。前者是靶向特异的miRNA分子与胞质中的核酸内外切酶、解旋酶等一起构成RISC,对靶mRNA进行切割,发挥基因沉默效应,该机制要求miRNA与靶mRNA严格互补;而抑制翻译机制,则是miRNA序列与mRNA3’UTR序列结合,抑制核糖体功能,从而抑制相应mRNA的翻译过程[5],该机制不需要严格互补,只要miRNA序列与靶向mRNA3’UTR序列部分互补结合,就可发挥作用,这种方式不影响靶mRNA的稳定性,只影响蛋白表达水平。该机制的存在使一个miRNA可以调节多个靶基因,而一个靶基因也可受多种miRNA的调节,使得调节机制更加复杂。在与靶基因识别过程中,miRNA5’端2~8个核苷酸几乎无一例外地能与靶mRNA3’UTR完全互补,在特异识别靶mRNA中起关键作用,被称为“种子序列”。虽然绝大部分研究集中于miRNA介导的基因沉默,但Vasudevan等[6]的研究显示miRNA也可以促进翻译过程。他们发现,在饥饿诱导的细胞周期G1捕获期间,miR369-3和人工合成的miRNA模拟CXCR可以增强mRNA翻译,而在其他细胞周期抑制翻译。这一研究无疑拓宽了miRNA对蛋白表达的作用,而且也增加了miRNA应用的复杂性。有研究显示miRNA还可去掉mRNA的poly-A尾从而加速靶向mRNA的降解,不需要二者碱基的严格配对[7],并有可能产生“旁观者效应”,加速其他mRNA的降解。

2 miRNA参与肿瘤病理过程的机制

2.1 激活癌基因或沉默抑癌基因 miRNA-221/222在多种恶性肿瘤中高表达。研究发现,在前列腺癌中miRNA-221以肿瘤抑制因子P27基因为靶点,转录后沉默其mRNA翻译过程,下调其功能表达[8]。P27是肿瘤抑制因子,在肿瘤中的表达通常被破坏,其缺失可增加肿瘤的发生率和增长率。P27的表达水平下降与肿瘤进展及肿瘤患者的不良预后呈正相关[9]。P16基因抑制周期素依赖性蛋白激酶4活性,维持PRB基因的低磷酸化,而使细胞分裂停留在G1期,在肿瘤组织中P16呈普遍的低表达状态。报道显示,在宫颈癌细胞株中miRNA-24与P16表达水平呈负相关,失活miRNA-24的表达可增加P16基因表达水平,并且miRNA-24的5’端“seed sequence”序列与P16 mRNA的3′端UTR区互补,认为miRNA-24下调P16水平而诱导肿瘤发生[10]。

2.2 调控凋亡基因 miRNA-15a/16-1可通过干扰BCL-2 mRNA增加肿瘤细胞凋亡活性,引起肿瘤细胞死亡。Lu Z等也发现,在乳腺癌细胞株MCF-7中,miRNA-21表达升高并可通过沉默程序化细胞死亡4基因的mRNA促进细胞增殖[11]。Wang等研究证实,携带致瘤基因HPV的宫颈癌组织和Caski,SiHa,HeLa,C411,ME180细胞株中显示肿瘤抑制基因miR-34a的表达减少。在器官组织中miR-34a表达的减少源于包含HPV的人类角质化细胞的早期生产阶段中病毒E6蛋白的表达,E6的表达影响肿瘤抑制因子P53(一种miR-34a的转录因子)。在HPV16(+)和HPV18(+)子宫颈癌细胞系中,E6的表达导致P53和miR-34a表达的增加。在HPV(+)Hela细胞和HPV(-)HCT116细胞中,miR-34a的异常表达导致细胞发育迟缓和适度的细胞凋亡。这是首次证明一种病毒致瘤蛋白能调节细胞miRNA的表达[12]。

2.3 细胞黏附 E-钙黏蛋白主要在乳腺癌中被广泛研究,有报道miRNA-9可通过调节E-钙黏蛋白表达影响乳腺癌细胞的侵蚀转移能力[13]。

2.4 诱导血管生成 一些miRNA分子可通过调节血管内皮细胞生长因子、环氧化酶2等改变肿瘤细胞的血管生长能力[14]。

2.5 增强肿瘤细胞侵蚀能力 miRNAs除了在促使原始肿瘤的发生过程中起作用外,同时还在肿瘤的进展包括致命性的肿瘤转移中起重要作用。肿瘤细胞的浸润是肿瘤转移的前提,而上皮细胞-间质转化(epithelial-mesenchymal transitions,EMT)在浸润过程中起重要作用。细胞转移生长因子(TGF-β)、转录因子Snail、基质金属蛋白酶(MMPs)及病毒癌基因可以诱导EMT;肿瘤细胞EMT与肿瘤细胞的浸润、转移、信号转导都有关系。研究肿瘤细胞EMT将为寻找抗肿瘤治疗新靶点奠定基础。

Tavazoie等微阵列芯片筛选了多个具有高度转移特性的乳腺癌MDA-MB-231衍生细胞株,发现一系列miRNA的异常表达与乳腺癌的远处转移密切相关。其中mir-335和mir-126对抑制肿瘤转移发挥着关键性作用;这两种miRNA表达缺失的乳腺癌患者生存率低。该试验表明miRNAs在乳腺癌的发生发展中起着重要的作用[15]。

miR-10b是Twist 1基因的直接转录靶点,而Twist 1是诱导EMT和肿瘤转移进展的一个基因。在非转移性乳腺癌细胞株中其异常表达miR-10b可促进细胞入侵和转移,这部分是由于直接抑制同源蛋白HOXD10的表达而导致的。

3 miRNA在肿瘤诊断中的作用

迄今为止,已有多个研究证实miRNA在不同类型的肿瘤中表达不同,可应用于肿瘤的诊断及分型。Lu Z等检测了334个样本中217种miRNA表达,样本包括多种肿瘤组织及正常组织,发现在不同肿瘤中miRNA表达不同;通过miRNA表达特征可进一步区分肿瘤的分子血亚型,如bcr-abl阳性样本;另外,在组织学无法准确诊断的17种恶性肿瘤中,通过miRNA筛选可区分该类肿瘤,较mRNA表达谱芯片更为准确。

Ng E K等就血浆中95种miRNA表达水平与结直肠癌的发生进行了比较系统地探讨。研究者采用实时定量RT-PCR的方法分别检测了结直肠癌患者和健康人血浆中的95种miRNA的表达情况,发现miR-92在结直肠癌患者血浆中的表达水平显著增高,有趣的是,并没有检测到miR-92在晚期结直肠癌患者血浆中过度性表达,提示血浆miR-92可以作为早期结直肠癌的诊断性标志物[16]。

miRNA的检测常用的方法包括RNA印迹分析方法、miRNA基因芯片(microarray)和实时定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)等。RNA印迹分析方法是研究miRNA表达水平最可靠的技术,常用于检测肿瘤细胞中miRNA的表达水平,但该技术有操作复杂、费力、费时的缺点。miRNA基因芯片技术是一种更理想的检测miRNA的表达图谱的方法,能同时检测多个miRNA,但miRNA基因芯片技术只能分析已知的miRNA表达水平,不能分析未知的miRNA。实时定量RT-PCR是实用价值很高的定性定量检测技术,具有用时少、灵敏度高、精确度高、重复性好、可以高通量检测、能有效区分miRNA前体分子以及其他成熟miRNA同源分子等优点,已被越来越多地应用于miRNA的检测。

最近的研究取得了一定的进展,我们了解到外周血中的miRNA很可能来源于机体多种组织及多种类型的细胞,包装于外染色体(exosome)或经过转录后修饰释放入血,从而免受RNase的降解[17-20]。Valadi等表示某些mRNA、miRNA选择性地包装于外染色体,似乎mRNA、miRNA有着自己的“命运”,这或许是不同来源的标本(组织、血清、血浆、全血等)含有不同种类miRNA的原因之一。

对miRNA在肿瘤中的表达特征、miRNA靶基因的证实,miRNA抑癌、致癌机制及其表达失调机制的研究,对于肿瘤的临床诊断、治疗和预后具有重要意义。miRNA将影响着肿瘤治疗的新进展已为期不远。

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