西藏黑木耳高产菌种不同生长发育时期转录组测序分析
2023-07-21张彦龙曾伟民
黑龙江大学自然科学学报 2023年3期
薛 娇, 于 洋, 张彦龙, 雷 虹, 曾伟民
(1.黑龙江大学 农业微生物技术教育部工程研究中心, 哈尔滨 150500; 2.黑龙江大学 生命科学学院, 哈尔滨 150080)
0 引 言
黑木耳属于真菌界,担子菌亚门,层菌纲,木耳目,木耳科,木耳属[1]。黑木耳口感脆嫩,味道鲜美可口,我国对其的食用已有上千年的历史。黑木耳子实体营养丰富,其多糖具有降血脂、抗血栓和抗肿瘤等作用[2],黑色素能够明显改善四氯化碳造成的急性肝损伤,多酚类和黄酮类物质具有抗氧化和清除自由基等功能。黑木耳在我国种植广泛,在云南、贵州、新疆、华北、内蒙古、西藏及东北地区均有分布。西藏黑木耳由于生长位置海拔较高和紫外线辐射较强的独特地理条件而具有抗逆性强、耐低温、生长周期短和营养价值高的优点[3]。
转录组在广义上是指整个细胞在某一特定条件或状态下所转录出的编码RNA和非编码RNA的总和,转录组学是在整体水平上研究生物个体所转录出RNA的差异情况[4]。转录组测序是通过将RNA进行测序,获得表达差异基因,注释到各个数据库从而进行分析。目前,用于转录组研究的主要有SAGE基因表达序列分析技术、大规模平行测序技术、转录组测序技术和基因芯片技术[5]。转录组测序技术并不局限于对已知转录本信息的样品进行检测,还可以利用高通量测序对无参考序列信息的样品进行检测。近年来随着测序成本的降低和其灵敏度高、检测范围广和重复性好的特点被广泛应用到各个领域。……
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