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人非小细胞肺癌组织中转录因子E2F家族表达与临床病理特征及预后的相关性分析

2022-08-21张涛元丁雪梅祝撷英曹三成

现代检验医学杂志 2022年4期
关键词:肺癌数据库差异

张涛元,丁雪梅,李 俏,祝撷英,曹三成,吴 爽

(1.青岛大学附属日照医院/日照心脏病医院,山东日照 276801;2.日照市中医医院,山东日照 276899;3.西安交通大学附属儿童医院,西安 710003)

肺癌是世界范围内严重威胁人类健康的癌症[1]之一,根据其组织学类型分为两类:小细胞肺癌和非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)。其中NSCLC 约占肺癌的85%,又分为鳞状细胞癌、腺癌和大细胞癌三类[2]。随着对NSCLC 发病机制的深入研究,NSCLC 的诊断和治疗手段提升较大,然而NSCLC 的5年总生存率(overall survival,OS)仍小于15%[3]。因此亟需寻找更多有效的生物标志物,用于预测NSCLC 的病理过程并作为潜在药物靶点,改善预后和实施个体化治疗。

迄今为止,转录因子E2F 家族共发现了8 个因子,并按其发现顺序进行编号(E2F1, E2F2, E2F3,E2F4, E2F5, E2F6, E2F7, E2F8)。有研究报道,E2F1, E2F2, E2F3, E2F8 与肺癌的发生密切相关[4-7],然而E2F 家族在NSCLC 中的表达、与临床病理相关性和可能的作用机制仍未见报道。

近些年,微阵列技术和生物信息技术已被广泛用于鉴定基因组表达水平的改变,帮助我们识别癌症相关的差异表达基因和相关信号通路。本研究利用生物信息学技术,分析E2F 家族在NSCLC 中的表达情况,探究其与NSCLC 分期、淋巴转移、患者预后之间的相关性,并聚焦其在NSCLC 中的基因突变情况,寻找致病机理,为NSCLC 的诊断提供新型标志物。

1 材料与方法

1.1 数据来源 通过在线数据库获取所需的非小细胞肺癌的临床病例数据,并对所有病例中E2F 家族的相关数据进行统计分析。

1.2 方法

1.2.1 E2F 家族在转录水平表达差异的验证: 利用Oncomine 数据库(www.oncomine.org)[8],比较E2F 家族在癌组织与正……

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