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水稻类病斑突变体基因克隆及发生机制研究进展

2022-07-16沈旺鑫史小品杜海波冯志明陈宗祥胡珂鸣范江波左示敏

江苏农业学报 2022年3期
关键词:分子机制表型基因克隆

沈旺鑫 史小品 杜海波 冯志明 陈宗祥 胡珂鸣 范江波 左示敏

摘要: 类病斑突变体 (Lmms) 是研究植物细胞死亡和防御反应机制的重要材料。本文对水稻类病斑突变体的最新研究进展进行了综述。在此基础上,对进一步加强类病斑突变体及其抑制突变体基因的鉴定与克隆、解析病健组织间细胞命运的精细调控机制,以及如何利用类病斑突变体开展抗逆分子设计育种进行了讨论。

关键词: 水稻; 类病斑突变体; 表型; 基因克隆; 分子机制

中图分类号: Q785   文献标识码: A   文章编号: 1000-4440(2022)03-0837-12

Research advances in gene cloning and occurrence mechanism of rice lesion mimic mutants

SHEN Wang-xin 1 , SHI Xiao-pin 1 , DU Hai-bo 1 , FENG Zhi-ming 1,2 , CHEN Zong-xiang 1,2 , HU Ke-ming 1 ,  FAN Jiang-bo 3 , ZUO Shi-min 1,2,4

(1.Jiangsu Key Laboratory of Crop Genomics and Molecular Breeding, Yangzhou University/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou 225009, China; 2.Co-Innovation Center for Modern Production Technology of Grain Crops of Jiangsu Province, Yangzhou University/Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province, Yangzhou 225009, China; 3.School of Agriculture and Biology, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China; 4.Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China)

Abstract:  Lesion mimic mutants (Lmms) are important materials for studying the mechanisms of plant cell death and defense responses. The current research progress of rice Lmms was summarized in this article. Furthermore, we discussed the strengthen of identification and characterization of more rice  Lmms  genes and relative inhibition genes, the elucidation of sophisticated regulating mechanism for the fate of cells between lesion tissue and its adjacent healthy tissue, and how to design biotic and abiotic stress resistance/tolerance breeding using the knowledge from Lmms.

Key words: rice; lesion mimic mutants; phenotype; gene cloning; molecular mechanism

植物在應对一些病原菌或病原小种侵染时会在侵染点附近产生过敏反应(Hypersensitive response, HR),即引起侵染点附近的细胞程序性死亡(Programmed cell death,PCD),以限制病原菌的侵染定殖,使植物产生抗病反应。当然,在寄主-病原菌间的长期协同进化过程中,不少病原菌或生理小种可以通过多种方式适应或抑制抗病反应,在寄主植物上成功定殖进而杀死寄主细胞,产生病斑,危害植物生长发育。自然界中,由于基因突变,有些植物材料在没有病原菌侵染的情况下,其叶片、叶鞘、茎秆等不同部位也会自发形成类似病斑症状的表型,研究人员将这类材料命名为类病斑或假病斑突变体 [1] 。绝大多数类病斑突变体被发现与植物抗病性密切相关,可显著增强防御相关基因的表达,激活防御反应,抑制病原菌的生长,增强抗病性  [2-17] ,因此,类病斑突变体的产生多数被认为与植物的PCD有关。然而,由于防御系统的持续或不当激活,多数类病斑突变体均存在不同程度的生长发育不良,但也有少数突变体表现正常或受影响较小 [18-19] ,这暗示其在作物广谱抗病育种中具有重要的应用前景。因此,广泛筛选不同类型的类病斑突变体,克隆相应基因并解析其发生机制,是研究植物抗病分子机制的重要策略,也将为植物抗病分子育种提供新思路,具有重要的理论价值和实际意义。

有关类病斑突变体基因的定位克隆,早期在拟南芥中的研究较多,目前在拟南芥 [2-3] 、水稻 [4-5,7,10-11] 、玉米 [6] 、花生 [8] 和大豆 [9,12] 等作物中也有广泛报道。水稻是重要的粮食作物,为全世界一半以上的人口提供食物,研究和鉴定水稻中的类病斑突变体基因具有重要的意义。截至目前,人们已报道了水稻中近100个水稻类病斑突变体,克隆了40余个相关基因 [13-106] 。本文对这些类病斑突变体的表型特征和遗传行为进行总结,进而对已克隆的基因及其影响类病斑产生的机制进行归纳,在此基础上对水稻类病斑突变体的下一步研究重点进行讨论和展望。本文希望对从事或欲了解该领域的研究者提供最新的进展介绍,同时希望吸引更多研究者在水稻类病斑的产生机制以及如何利用其产生机制开展抗病分子育种研究等方面开展深入思考与讨论,最终为水稻抗病机制解析及育种实践提供新理论和新思路。

1 水稻类病斑突变体的类型

1.1 水稻类病斑突变体的表型复杂多样

自水稻第一个类病斑突变体( Sekiguchi lesion, sl ) [17] 被发现以来,已报道的近百个水稻类病斑突变体 [4-5,7,10-11,13-106] 在类病斑表型上存在明显差异,这也可能是不同学者采用差异化命名方式的缘故,但多数是以spot leaf(spl)、lesion mimic(lm)和lesion resembling disease(lrd)等开头进行命名。

总体而言,类病斑突变体间的症状差异主要表现在病斑形状和颜色上,如突变体spl31 [38] 和spl y181  [43] 的类病斑形状为不规则型,而spl24 [19,34] 和 dj-lm  [88] 等则表现出非常规则的类病斑形状。在颜色上,分别有黑色(SPL3 [6] 和spl16 [30] )、棕红色(spl18 [31] 和lrd33 [54] )、黑褐色(spl33 [40] 和SPL35 [42] )和白色(spl20 [30] )等多种类型。

另外,不少突变体的类病斑表型呈现一定的组织特异性、发育依赖性以及易受环境因素诱导等特征,同时,多数类病斑突变体的表型会随着植株的生长发育而显著加重(尤其是在孕穗期后期)。如此复杂多样的类病斑表型,表明水稻类病斑形成的机制网络十分复杂。

1.2 多数类病斑突变体呈现发育依赖性特征

绝大多数类病斑突变体的病斑产生与植株生长发育的进程相关,呈现出一定的发育依赖性特征。如spl1和lbsl1等突变体在播种后15 d左右的早期幼苗中就会出现明显的类病斑症状 [30] ,spl29 [36] 和lmm1 [40] 等突变体的幼苗则分别要到3叶期或4叶期时才会出现类病斑症状,而spl11 [25] 和lmm4 [83] 等突变体在苗期基本没有症状,要到分蘖期后才会出现类病斑癥状。总体而言,随着生长发育的进行,大多数类病斑突变体的症状会逐渐加重,说明生长发育进程对类病斑的形成会产生显著影响。

1.3 外界环境因素会诱导或抑制类病斑症状的发生

外界环境因素包括光照、湿度、温度等,不少研究发现这些环境因素会或多或少影响类病斑症状的发生或发生程度。研究结果显示,绝大部分水稻类病斑突变体都是受光照影响。通过铝箔片等遮光处理,发现spl30 [37] 和SPL35 [42] 等水稻类病斑突变体叶片的遮光部分不会出现类病斑症状,说明它们的表型是受光照诱导的。spl7 [23,54] 和lrd32 [86] 等的类病斑表型受温度影响,如spl7在26 ℃以下不会出现类病斑,但在高于35 ℃时叶片上会出现明显的类病斑症状;与之相反,lrd32的类病斑症状在低温(23 ℃)条件下则发生得非常明显。在类病斑突变体 lrds 的研究中还发现,类病斑症状的产生还受光波长的影响,如lrd32和lrd40在红光(波长626~ 629 nm)、蓝光(波长465~ 468 nm)和白光(蓝光+黄光混合,波长分别为465~ 468 nm 和556~ 559 nm)下均可产生类病斑症状,而lrd35和lrd37在蓝光和白光下、lrd36只在白光下产生类病斑表型 [54] 。有关湿度影响类病斑症状的研究在水稻上还未见报道,但在拟南芥中,有研究者发现,湿度较高的环境会抑制 cpnine 突变体的类病斑症状产生 [84] 。总体而言,多数研究结果显示,外界环境因素对水稻类病斑的产生存在显著影响。

1.4 类病斑症状呈现一定的组织特异性和非特异性特征

比较不同类病斑突变体的症状表型,发现不同突变体的类病斑症状在发生位置上存在明显差别(图1)。如,突变体spl22 [30] 、lmes1 [50]  和ltn1 [53]  的类病斑症状会特异地出现在叶尖上;而spl2 [18] 和spl30 [37] 的类病斑则分布在叶片的一侧。突变体spl19 [30] 、spl26 [34] 和lrd33 [54] 无论在苗期还是生育后期,其在叶脉附近均没有类病斑症状,而主要发生在叶脉两侧。与之相反,spl31的类病斑症状则会特异地出现在叶脉上 [17] 。

绝大部分类病斑突变体的类病斑症状均出现在叶片上,但也有少数突变体的类病斑症状会同时在叶鞘和茎秆等组织部位发生。如,突变体rlin1 [65] 除了在叶片上有类病斑症状外,在叶鞘上也有分布,但是突变体nls-1D [74] 的类病斑症状则特异地出现叶鞘上。一般而言,组织非特异性通常是指类病斑发生在多个组织部位,而发生在多个组织部位的类病斑突变体通常会出现早衰特征,如突变体spl29 [36] 和SPL35 [42] 。类病斑突变体的组织特异性和非特异性特征,说明突变的相应基因在植物生长发育中具有组织/功能特异性或非特异性表达。

2 水稻类病斑突变体的遗传方式与基因克隆

2.1 水稻类病斑突变体的遗传方式

截至目前,所有已报道的水稻类病斑突变体的遗传模式均符合孟德尔遗传定律,其中绝大多数都呈现单基因隐性遗传,且多为靶基因功能丧失型突变 [10-99] 。但是,也有少数突变体表现为单基因显性和/或半显性遗传,如spl18 [31] 、OsNPR1/NH1 [58-59] 和rlr1 [69] 等突变体。此外,突变体lrd32 [54] 、nls-1D [74] 和 lmm5 [93] 中的类病斑症状受双基因控制,呈现双基因隐性遗传和/或双基因半显性遗传模型。

2.2 水稻类病斑突变体及抑制突变体的基因克隆

随着遗传学和分子生物学的快速发展,目前已有41个水稻类病斑突变体中的目标基因被克隆(表1)。其中,大多数是通过图位克隆获得的,但也有少数采用其他方法,如最新报道的突变体nbl3 [99] ,是采用T-DNA插入位点的侧翼序列法分离获得的。这表明,经典的图位克隆仍然是目前分离水稻类病斑突变体基因的最主要方法。

表1归纳了目前已克隆的41个引起类病斑症状的基因及其相关信息。从基因号上可知,这些基因分布在水稻12条染色体上,其中1号、3号和12号染色体上分布得最多,各有5个基因被克隆;最少的为6号和9号染色体,均只克隆到1个基因。这些基因编码的蛋白质涉及多种功能类别,但总体以酶类居多,有20个,如酰基转移酶、脂氢过氧化物裂解酶、脂肪酸脱氢酶和ATP-柠檬酸裂解酶A等;其次为编码未知生理功能的蛋白质,总计有16个,如锌指蛋白、锚定蛋白、含NB-ARM结构域的新型蛋白质等;其余5个分别编码具有转录因子、真核生物翻译释放因子、剪切因子等功能的蛋白质因子。这些基因广泛涉及叶绿体、线粒体和高尔基体等细胞器发育调控,水杨酸(SA)、乙烯(ET)、茉莉酸(JA)和脱落酸(ABA)等激素合成与代谢信号,免疫信号、光合作用以及泛素化等多种生理生化途径。另外,发现大多数突变体均表现对稻瘟病或白叶枯病的抗性增强,不同程度地激活免疫反應。最近报道了一个编码五肽重复序列蛋白质的基因OsNBL3,其突变除了表现抗病性之外,还表现出对非生物逆境如盐害具有较强的抗性 [99] 。相比于类病斑突变体基因,水稻类病斑抑制突变体基因的克隆进展总体较慢,迄今只有1例关于spl11类病斑表型的抑制基因SDS2被鉴定克隆的报道 [26] 。研究结果显示,SDS2编码1个特异性类受体激酶,参与调控免疫反应过程中的一个重要信号分子活性氧(Reactive oxygen species,ROS)的生产。

总体而言,目前已克隆的这些类病斑及类病斑抑制基因所编码的蛋白质涉及的细胞功能复杂多样,但多数均会激活对生物甚至非生物逆境的抗性,这将为进一步研究细胞死亡相关的免疫调控网络提供重要的基因资源。

3 水稻类病斑的产生机制

植物细胞在受到各种环境刺激后的早期阶段一般都会产生ROS,主要包括超氧阴离子(O2  ·- )、过氧化氢(H2 O2 )、羟基自由基以及一氧化氮(NO)等成分。ROS迸发是一个十分复杂的过程,过量积累会产生氧化胁迫,破坏细胞的结构,损伤DNA、脂类、蛋白质等生物大分子,并最终导致细胞死亡 [107] 。ROS也是调控植物生长发育、逆境响应和PCD等生理过程的重要信号分子 [108-111] 。已报道的几乎所有类病斑突变体中均检测到了ROS过度积累现象,因此,尽管这些突变体基因的信号调控网络/机制还不清楚,但结合ROS的生理功能,似乎均可将这些类病斑的产生归结为ROS的异常迸发(图1)。为此,我们从可能诱导ROS产生的因素出发,结合已克隆的类病斑突变体基因的生物学功能,将当前水稻类病斑的产生机制归纳为以下3个方面:

3.1 防御反应异常引起的类病斑

泛素化修饰在调节植物免疫反应上具有极其重要的作用,很多防御蛋白质在完成信号传递后会通过泛素化修饰途径被及时降解,以免引起过度免疫反应影响正常生长发育。在哺乳动物中,研究发现 BAG 家族基因直接参与启动PCD。ebr1基因编码一个E3泛素连接酶,在细胞内可与BAG家族蛋白质OsBAG4直接互作并通过泛素化促进其降解;相反,ebr1突变体中OsBAG4的蛋白质积累水平明显增高,激发了PCD和免疫反应(图1),导致类病斑的产生 [67] 。G蛋白复合体在植物免疫信号调控中也具有重要作用 [112] 。其中编码小G蛋白的基因OsRac1激活表达,会引起ROS积累、激活植物免疫反应 [87] 。spl11基因编码U-box类型E3泛素连接酶,可促进RhoGAP蛋白SPIN6的泛素化降解,而SPIN6蛋白具有RhoGAP活性并可与OsRac1结合,促进OsRac1-GTP水解,使其转变为OsRac1-GDP失活态。因此,spl11和SPIN6基因的突变均可引起OsRac1基因的持续激活,造成ROS过度积累,引起细胞坏死  [25,27] 。通过诱变,在spl11背景中获得1个无类病斑表型的抑制突变体sds2 [97] 。图位克隆结果显示,SDS2可与SPL11直接互作并磷酸化SPL11,SPL11又可以泛素化SDS2引起其降解;进一步研究发现,SDS2可以与类受体胞质激酶OsRLCK118相互作用,后者可通过磷酸化OsRbohB,促进ROS的积累。这说明SDS2能否被及时地泛素化降解与ROS过度积累间密切相关,也解释了SDS2的突变为何能抑制spl11类病斑表型的机制 [26] 。此外,SPL35编码1个包含CUE结构域的蛋白质,能直接与泛素结合酶OsUBC5a和Delta-COP1、Delta-COP2发生互作,这些互作蛋白质表达水平的下调均会形成类似SPL35突变体的类病斑表型和激活防卫反应,暗示SPL35突变体的类病斑症状产生也与泛素化途径受影响有关 [42] 。

SA、ET、JA和ABA是调控植物免疫反应的重要激素信号分子。NPR1是水杨酸介导的免疫反应中的重要中枢性调节因子 [100] 。OsCUL3a突变体中的靶基因OsCUL3a编码1个基于Cullin3的环型E3泛素连接酶,其可以与OsRBX1a、OsRBX1b互作形成1个多亚基环型E3泛素连接酶;同时OsCUL3a也可与OsNPR1互作,并通过26 S蛋白酶体系统促进OsNPR1的降解。因此,OsCUL3a突变体的类病斑产生应该与OsNPR1持续激活引起免疫反应有关 [85] 。hpl3突变体表现整片叶的类病斑表型,研究结果显示,OsHPL3可通过影响JA等的含量来调控免疫反应 [55,104] ,最终影响类病斑的产生。OsEDR1的同源基因SPL3可通过影响ABA和ET的生物合成,调控活性氧代谢和叶片衰老,导致类病斑表型 [6] 。Osssi2突变体中的SA和/或苯丙噻唑硫代乙酸甲酯(BTH)含量明显增加,并特异性诱导了OsWRKY45的微弱表达,从而持续激活免疫反应,产生类病斑症状 [63] 。

RAR1是植物防卫反应中的关键调控因子 [105] 。研究结果显示,突变体ttm1的类病斑表型与OsPti1a基因被破坏有关,该基因编码一个蛋白质激酶,负调控水稻的防御反应;而ttm1抑制OsRAR1基因表达时,可显著抑制突变体中的免疫反应,表明OsPti1a基因负向调节OsRAR1 介导的免疫反应 [60] 。抗病相关蛋白OsEDR1可与OsMPKK10.2互作并抑制其活性,当病原菌入侵时,OsMPKK10.2被激酶磷酸化后会激活OsMPK6,OsMPK6进而又磷酸化OsEDR1并促进其降解,进一步释放OsMPKK10.2,使得OsMPKK10.2-OsMPK6信号级联被放大,增强水稻的免疫反应。因此,在OsEDR1突变体中,OsMPKK10.2和OsMPK6的活性均得到了明显增强,免疫反应被持续激活,引起类病斑症状。在OsEDR1突变体中,如果敲除OsMPKK10.2,则双突变体的类病斑症状明显减弱,证明OsEDR1突变体产生的类病斑症状与OsMPKK10.2激活的免疫反应有关 [103] 。

总体而言,目前有关免疫反应中如何快速诱导PCD和ROS的产生机制还不清楚,利用更多的类病斑突变体有望加快这一调控网络的解析。

3.2 光合系统和细胞器异常引起的类病斑

目前,在已克隆的类病斑突变基因中,有6个基因编码的蛋白质亚细胞定位于叶绿体、4个定位于内质网、2个定位于线粒体和1个定位于过氧化物酶体。有报道显示,植物细胞的细胞壁、质膜、叶绿体、线粒体、过氧化物酶体和内质网等部位均可产生ROS,其中叶绿体、线粒体、过氧化物酶体是ROS 产生的最主要细胞器 [113] 。不少研究结果显示,光合系统中存在1个精准的稳态调控系统,该系统失衡一般均会引起ROS积累 [71] 。如,SPL32编码1个铁氧还蛋白依赖性谷氨酸合酶 Fd-GOGAT ,该基因编码产物定位于叶绿体,其突变会降低光呼吸速率,破壞ROS清除途径,导致ROS大量积累,引起细胞死亡 [39] 。ELL1编码细胞色素P450单加氧酶,参与叶绿体发育,其突变体ELL1的叶绿素含量明显下降,叶绿体降解相关基因上调表达,叶绿体降解严重,最终导致ROS的过量积累,引起细胞坏死 [86] 。有研究结果显示,叶绿素合成途径中许多酶的功能丧失或叶绿素合成受阻均可能导致类病斑表型 [65] 。叶绿素合成关键酶 LPOR和NADPH 可催化原叶绿素酸酯生成叶绿素酸酯, fgl 突变体中总叶绿素酸酯和感光叶绿素酸酯含量均明显下降,在强光照条件下,突变体 fgl 中新出的叶片会迅速黄化并产生类似病变的症状 [70] 。WLL1编码二氧四氢蝶啶合成酶,参与核黄素合成,由于WLL1基因功能的缺失引发ROS积累和叶绿体的退化,从而引起突变体发生细胞死亡 [106] 。

突变体 dj-lm 中的靶基因编码蛋白质OsDRP1E,其突变直接影响线粒体嵴的形态发生变化。在哺乳动物中,线粒体嵴异常会导致细胞色素c从线粒体释放到细胞质中,诱导细胞内富含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶产生活性,发生凋亡蛋白酶的级联反应,降解细胞内的重要蛋白质,导致细胞死亡 [114] 。因此,推测突变体 dj-lm 中的类病斑表型可能也与线粒体嵴异常导致线粒体中细胞色素c不正常释放有关,但是具体机制尚不明确 [88] 。最近报道的OsNBL3基因编码一个PPR蛋白,也是线粒体发育和功能发挥的重要组成部分,其破坏可使水稻发生类病斑 [99] 。SPL28蛋白参与高尔基体的物质运输途径,可能参与囊泡运输调控,其突变体会破坏H2 O2 的平衡、光合系统的稳定以及光合胁迫适应性,引起类病斑症状和早衰现象 [35,71] 。这些研究结果表明,光合系统及一些细胞器的功能正常与否可能是影响一些突变体产生类病斑的原因之一,但是具体的分子调控机制还不清楚,有待深入研究。

3.3 其他途径异常引起的类病斑

研究结果显示,一些涉及生长发育信号等途径的异常,也会引起ROS的过度积累,最终触发细胞死亡(图1)。如,OsLOL1编码水稻中的1个C2C2型锌指蛋白,可与OsbZIP58互作并通过其激活OsKO2基因表达,进而影响赤霉素生物合成和超氧化物歧化酶的活性,导致ROS清除能力下降,造成局部的细胞死亡 [57,101] 。 LMR 编码1个与多种细胞活性相关(AAA-type)的ATP酶,可介导多囊泡体的囊泡运输,抑制水稻的免疫反应和细胞死亡,因此其突变体表现为免疫反应过度激活和细胞坏死 [51] 。noe1编码水稻过氧化氢酶 OsCATC ,负责降解H2 O2 ,在noe1突变体中的H2 O2 含量明显增高,同时激活硝酸还原酶活性并且促发一氧化氮(NO)的产生,而NO也是参与水稻中H2 O2  诱导叶片细胞死亡的重要因子 [14] 。spl7 编码1个热胁迫转录因子,在其敲除和过表达时均会引起ROS积累,导致类病斑表型,在spl7突变体中抑制 NADPH 氧化酶活性时,可明显抑制突变体中的ROS积累,减弱类病斑表型 [24] 。

在医学研究中,5-羟色胺是一种神经递质,能保护神经元免受兴奋神经毒素的损害,但5-羟色胺有致死细胞的作用 [17] 。SPL5编码SF3b3剪切因子,可能是通过调节植物RNA剪接来负调控细胞死亡和抗性应答 [22] 。最新的研究结果显示,SPL5可能是通过OsWRKY14负向调控5-羟色胺代谢,因此,SPL5突变体中的类病斑症状可能与其积累过多的5-羟色胺有关,当然,SPL5基因突变也可能会影响其他触发类病斑的生物学途径 [28] 。rlin1编码1个可能参与四吡咯生物合成途径的粪卟啉原Ⅲ氧化酶,因为碱基替换产生了错义突变,形成氨基酸的变化,异源表达rlin1时可以互补rlin1的类病斑表型,进一步通过组织化学分析结果表明,rlin1突变体中伴随着ROS的积累,表明四吡咯参与了水稻类病斑的形成 [65] 。spl29编码尿苷二磷酸- N -乙酰葡糖胺焦磷酸化酶,在spl29突变体中,超氧化物歧化酶活性增加而过氧化氢酶活性正常,这导致ROS的积累,造成叶片早衰(细胞死亡加快的一种)等类病斑表型 [36] 。

上述研究结果显示,植物中的细胞死亡及其调控网络异常复杂,通过发掘更多类病斑突变体材料并解析其分子机制是解析相关网络的重要途径之一。

4 研究展望

综上可知,类病斑突变体的鉴定及基因克隆将有力推进免疫信号网络的研究,加上多数类病斑突变体均具有较强的抗病表现,因此加强类病斑突变体基因的鉴定、克隆具有十分重要的理论价值和实际意义。结合当前研究中存在的问题,我们提出3个围绕类病斑突变体材料的未来重点研究方向。

4.1 加强类病斑突变体及其抑制基因的克隆和相关调控网络研究

迄今为止,大约有100个水稻类病斑突变体的遗传研究被报道,但只有41个基因被克隆,有关类病斑表型的抑制子基因仅克隆到个别。造成这一状况的主要原因可能与不少类病斑突变体的表型微弱、易受环境影响、不易鉴定有关,也可能与从事这一领域的研究人员偏少有关。细胞凋亡无论在动物还是在植物的生命活动中均是一个极其重要的生命事件,因此解析其中的信号调控网络/机制无疑具有十分重要的理论价值和意义。植物类病斑突变体材料是研究植物细胞凋亡控制机制的重要材料,因此,未来应该加强水稻类病斑突变体尤其是微弱表型突变体及类病斑抑制基因的鉴定和克隆工作。对于已克隆的类病斑突变体基因,应加强其互作蛋白质的筛选、鉴定及在调控类病斑表型上的生物学功能解析。

此外,目前報道的类病斑突变体涉及组织特异性、时空特异性、病斑规则和不规则等多种类型,分离其中的靶基因固然重要,但对这些靶基因之间的遗传关系研究也是一个十分重要的内容,目前却鲜有相关的研究报道。因此,未来可通过广泛配制不同类型突变体之间的杂交分析群体,加强相关突变体基因间的遗传关系分析。

4.2 加强病、健组织间的细胞精细调控机制研究

已报道的类病斑突变体中有些症状呈现大小、形状一致的规则特征,也有些规则性不强。但是,无论哪种突变体,其细胞坏死症状均不可能无限制地扩大,或者说有一种机制能被快速激活以确保病斑周边的细胞存活,解析这一精细调控机制具有极其重要的理论价值和实际意义。在寄主与病原菌互作中,由病原菌效应子触发的免疫反应ETI通常伴随着PCD,但也不可能无限制地扩展。最近研究发现,SA免疫信号中的关键基因OsNPR1,是ETI中决定病斑与健康组织间细胞死亡或生存的关键调控因子,这一成果发表在国际著名期刊《Cell》上 [100] 。值得注意的是,在类病斑突变体中,有些引起细胞坏死的基因似乎并不是免疫信号中的基因,而是参与叶绿体、线粒体等细胞器发育的关键基因。这暗示在这些突变体中,类病斑周边健康细胞中有快速替代该基因完成相应功能的其他基因;但是,由于类病斑还是有规则地出现,这又说明这一功能替代机制与基于SA和OsNPR1激活的长距离细胞生存调控机制间存在明显不同。因此,未来有必要加强类病斑毗邻的健康细胞存活机制的研究。

4.3 加快类病斑突变体在抗病耐逆分子设计育种中的应用研究

绝大多数类病斑突变体均表现出对白叶枯病和/或稻瘟病的较强、较广谱的抗性。然而,由于持续激活免疫反应,多数类病斑突变体的生长发育和谷粒产量均存在不同程度的下降。因此,如何合理利用这些类病斑突变体的广谱抗病机制,开展抗病分子设计育种研究,值得深入探索。为此,我们初步提出3个研究设想:一是选择时空特异表达的类病斑突变体或弱病斑突变体,开展育种应用,实现不显著减少产量损失的同时提高抗病性;二是结合绝大多数突变体中的靶基因均为功能丧失型突变的特征,未来可以尝试采用病原菌特异诱导的RNAi技术,创建一些特异诱导表达的转基因广谱抗病水稻;三是可以尝试通过基因编辑技术,创制一些类病斑突变体基因不同等位变异材料,尝试从中筛选弱突变等位变异,实现产量与抗性的平衡。另外,最近研究结果显示,类病斑突变体显著增强了对非生物逆境的耐性,这明显拓宽了以往对类病斑突变体抗病性增强的认识,因此,未来可以加强观测类病斑突变体在各种非生物逆境中的表型,探讨在抗逆性育种中的潜在应用前景。总体而言,随着各种分子技术及更多类病斑突变体的形成机制被解析,未来应该会有更多利用类病斑突变体开展抗病和抗逆分子设计育种的新思路产生。

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(责任编辑:陈海霞)

收稿日期:2021-11-23

基金项目:国家自然科学基金项目(31872858);江苏省重点研发计划项目(BE2019339);江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室开放课题(PL201905)

作者简介:沈旺鑫(1994-),男,江苏扬州人,硕士研究生,主要从事水稻抗病遗传分子育種。(E-mail) shen_wangxin@163.com

通讯作者:左示敏, (E-mail) smzuo@yzue.edu.cn

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