尹虹

(南方医科大学基础医学院，广东 广州 510515)

Nudix水解酶(nucleoside diphosphates linked to some moiety X，Nudix)广泛存在于真核生物、古细菌、细菌和病毒中，是一类需要Mg2+的酶，Nudix水解酶拥有一个保守的Nudix基序-GX5EX7REVXEEXGU，其中U通常是Ile，Leu或Val[1-3]。Nudix水解酶根据其水解底物的不同进行分类，其水解底物包含有核苷酸糖，二核苷酸聚磷酸， NADH，ADP-核酸，脱氧核糖核苷酸三磷酸，核糖核苷酸三磷酸等[3]。所以，Nudix水解酶不仅能调节各生化途径的中间代谢产物的积累，还可以清除细胞内产生的有毒代谢产物[4-5]。目前，已发现28个拟南芥Nudix水解酶基因，分别分布于细胞质(AtNUDT1-11、AtNUDT25、AtDCP2)、叶绿体(AtNUDT12-18)和线粒体(AtNUDT19-24、AtNUDT26-27)中[2,6]164-168。Ishikawa等[7]发现拟南芥AtNUDT6基因能通过调节NADH正向调控NPR1依赖的水杨酸信号通路。AtNUDT7基因不仅是EDS1信号通路的负调控因子，同时也是2个不同防御途径的负调节因子，既参与植物细胞程序性死亡，也与保持内稳态的平衡相关[8-10]。以往的研究集中在单个拟南芥Nudix水解酶基因缺失或过表达对植株造成的影响，很少有研究探讨2个或多个以上拟南芥Nudix水解酶基因缺失时的分子机制，因此本研究利用BRB-Array Tools基因芯片数据分析软件对来源于公共基因芯片数据库(gene expression omnibus，GEO)的AtNUDX6和AtNUDX7基因共缺失型植株的基因表达谱芯片数据进行差异表达基因筛选，通过生物信息学分析，从整体上了解其信号通路和基因组的变化，进而了解其分子机制[11-13]。

1 材料和方法

1.1 研究材料

本文所用的数据集来自NCBI里的GEO数据库，这个数据集的序列号为GSE74346。所用芯片都是Affymetrix第1代拟南芥基因组芯片，其中包含22 746个拟南芥基因，实验中，总RNA均来自植株的子叶。……