NDV感染的HeLa细胞的外泌体microRNA的表达谱及生物信息学分析
2021-12-27周昌娈孟春春孙英杰仇旭升刘炜炜宋翠萍
周昌娈,丁 铲,孟春春,孙英杰,仇旭升,廖 瑛,刘炜炜,宋翠萍,谭 磊
(中国农业科学院上海兽医研究所,上海 200241)
外泌体是一种由细胞主动分泌的具有脂质双分子层结构的囊泡,直径为30~150 nm,其形状类似于茶托或一侧凹陷的半球形[1]。在外泌体发现初期,研究者一直认为其功能仅仅为携带细胞废弃蛋白[2],但约十年后发现,外泌体是另一种新型的细胞间通讯方式[3],参与肿瘤细胞的侵袭、迁移以及肿瘤微环境的形成等过程[4-5]。近些年研究结果发现,外泌体内容物极其丰富,包括RNA[6]、蛋白[7]以及脂类[8],其中microRNA是占比最多的一类[9]。
microRNA是一类高度保守的大小约为21 nt的非编码RNA,通过其种子序列以完全或不完全匹配的方式结合靶基因3'UTR,在转录或转录后水平上实现对靶基因表达的调控[10],目前已有多篇关于microRNA在病毒感染中作用的报道研究[11-13]。新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV),单股负链RNA病毒,属副粘病毒科,能够在禽类生产中引起较大的经济损失,近年来,NDV在肿瘤治疗[14-15]以及病毒载体[16]等方面展现出较大的研究潜力。然而目前关于外泌体中microRNA在NDV感染过程中的作用仍鲜有报道。
为此,本研究利用NDV感染HeLa细胞,收集细胞上清液,分离提取外泌体,并采用microRNA芯片技术分析microRNA表达情况,比较NDV感染的HeLa细胞的外泌体与未经病毒感染的HeLa细胞的外泌体两样本之间的microRNA表达差异,以期为后续外泌体microRNA在NDV感染中的研究提供初步理论基础。
1 方法与材料
1.1 细胞与试剂宫颈癌细胞株HeLa由中国农业科学院上海兽医研究所水禽病毒病团队提供。……
