SNP单体型分析的不同策略应用于COL1A1成骨不全症家系PGT-M的临床研究
2021-12-23王洁朱丽华陈林君林飞刁振宇徐志鹏王珊珊张宁媛
王洁,朱丽华,陈林君,林飞,刁振宇,徐志鹏,王珊珊,张宁媛
(南京大学医学院附属鼓楼医院生殖医学中心,南京 210000)
成骨不全症(Osteogenesis imperfecta,OI)是一种罕见的系统性结缔组织疾病,其特征是骨密度较低、骨质脆弱、复发性骨折和进行性骨畸形,也可表现为关节松弛、蓝巩膜和耳聋等[1-2]。OI具有遗传异质性,遗传方式包括常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传或伴X染色体遗传[3]。OI的发病率约为1/10 000,其中约90%的发病属于由编码Ⅰ型胶原蛋白的COL1A1/COL1A2基因的杂合突变导致胶原形成障碍的常染色体显性遗传病[4-6]。
目前OI还没有特别有效的治疗方法,因此针对携带致病突变的家系开展胚胎植入前单基因病遗传学检测(Preimplantation genetic testing for monogenic/single gene defects,PGT-M)是最好的应对策略。另外,PGT-M能够筛选出基因型正常的胚胎,可以避免等到产检发现致病突变而终止妊娠给母体带来的身心创伤。在PGT-M中,应用基于二代测序(Next generation sequencing,NGS)的单体型分析,既可以将致病基因所在的染色体与其同源染色体区分开,又可以避免由直接检测中等位基因脱扣(Allele dropout,ADO)或重组导致的误诊,对常染色体显性遗传病的PGT-M具有重要的临床意义[7-9]。对突变位点进行一代测序再联合基于NGS的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)单体型分析技术能提高胚胎期检测结果的准确性,显著降低误诊率[10-11]。并且,在PGT-M的SNP单体型分析中,先证者、溯源的家系样本、无法溯源家系的患者或新发突变患者的配子或胚胎的遗传信息均可以用于连锁分析[12-13]。因此,不同SNP单体型分析策略能适用于更多类型的患者。
本研……
