安欢欢 ，钱莎莎 ，于代冠 ，申硕 ，2，3

1.武汉生物制品研究所有限责任公司，湖北武汉430207；2.国家联合疫苗工程技术研究中心，湖北武汉430207；3.湖北省疫苗技术创新中心，湖北武汉430207

2019 年12 月，中国湖北省武汉市监测发现不明原因新型冠状病毒肺炎，简称“新冠肺炎”。2020 年2 月 11 日，世界卫生组织（World Health Organization，WHO）正式将此新冠肺炎命名为2019 年冠状病毒病（Coronavirus Disease 2019，COVID-19）。国际病毒分类学委员会（The International Committee on Taxonomy of Viruses，ICTV）将引起 COVID-19 的病毒命名为严重急性呼吸道综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus-2，SARS-CoV-2）［1］。新冠肺炎已纳入《中华人民共和国传染病防治法》规定的乙类传染病，并按照甲类传染病管理，其具有传染性强、潜伏期长、传播途径复杂等特点，感染患者的临床病征表现为发烧、呼吸道症状、严重的呼吸系统疾病和肺炎［2］。

SARS-CoV-2 是单股正链RNA 病毒，基因组长度约为29 800 bp，拥有已知RNA 病毒中最大的基因组。SARS-CoV-2 基因组结构遵循冠状病毒（coronaviruses，CoVs）已知的特定基因特征，5′端具有帽子结构，3′端具有多聚腺苷酸尾巴。SARS-CoV-2 基因组含有10 个开放阅读框（opening reading frame，ORF），可能共编码至少 29 种蛋白质［3］。位于基因组5′端且超过 2 ／ 3 的区域含有 1 个具有移码重叠位点的ORF，称为ORF1ab，翻译可生成两条多聚蛋白pp1a 和pp1b，后者通过核糖体移码机制进行翻译，并由病毒编码的蛋白酶（main protease 和papain-like protease）剪切加工生成16 个非结构蛋白（分别命名为 NSP1 ~ NSP16），组装释放复制-转录复合体［4］。位于基因组3′端的1 ／ 3 区域编码4 种病毒结构蛋白，包括刺突糖蛋白（spike glycoprotein，S）、包膜蛋白（envelope protein，E）、膜蛋白（membrane protein，M）和核衣壳蛋白（nucleocapsid protein，N）。此外，SARS-CoV-2 基因组3′端还编码每个CoV 特有的种属特异性辅助蛋白，分别为ORF3a、ORF6、ORF7a、ORF7b、ORF8、ORF9b 和 ORF10，由 3′端一系列亚基因组 mRNAs（subgenomic mRNAs，sgmRNAs）表达［5］。其中一些辅助蛋白装配于病毒颗粒，如3a 在SARSCoV 被发现为结构蛋白［6］，3a 在 SARS-CoV-2 的分子数与分子数丰度最高的结构蛋白M 相当［7］。……