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成人重症哮喘诱导痰差异表达基因生物信息学分析

2021-12-13陈晓文李中鹏李章紊

医学研究杂志 2021年11期
关键词:差异分析

陈晓文 李中鹏 王 芳 李章紊 吴 健

支气管哮喘是全球范围内最常见的慢性呼吸道疾病之一,根据Th2 细胞因子是否参与其病理生理发展可将哮喘分为2 型和非2 型[1]。全球哮喘患者达3.58亿,患病率较1990年增加了12.6%[2]。王辰院士团队于2019年在《Lancet》杂志上发表了中国哮喘流行病学研究结果,中国哮喘病人总数约有4570万,20岁及以上人群的哮喘患病率为4.2%,其中重度哮喘占5.99%,提示我国哮喘防控形势严峻[3]。

持续24h仍不缓解的哮喘称为哮喘持续状态或重症哮喘。重症哮喘的临床表现为发作性呼气性呼吸困难,双肺哮鸣音的呼吸系统急症。重症哮喘患者症状不受控制、经常恶化,伴随着肺功能的下降,严重影响患者的生存质量,甚至危及生命[4, 5]。近年来针对其发病机制的研究,使阻断多个分子靶点的生物制剂出现成为可能,如与免疫球蛋白E(IgE)、白介素(IL)-4、IL-5和IL-13等2型炎症生物学标志物升高相关的2型哮喘。然而,2型炎症仅能解释约半数重症哮喘发病机制,而关于非2 型哮喘的研究较少[6]。

诱导痰细胞学是确定哮喘炎症表型的金标准,常用于评估气道炎症[7]。随着组学研究的兴起,利用诱导痰寻找重症哮喘新生物学标志物的方法取得了突破[8]。筛选新的靶点,有可能作为重症哮喘患者治疗新靶标。本研究对正常人与重症哮喘患者诱导痰基因芯片数据进行分析处理,旨在鉴定候选的重症哮喘疾病进展中诱导痰显著差异表达的关键基因。

材料与方法

1.数据集筛选:NCBI的GEO数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)是一个公共功能基因组数据库,创建于2000年,收录全世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据。……

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