宋姗姗，宋兴超，张如，杨童奥，刘琳玲，丛波，林鹏

（1.中国农业科学院特产研究所，吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室，农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室，吉林长春130112；2.铜仁学院，贵州铜仁554300；3.渤海大学食品科学与工程学院，辽宁锦州121013）

分子标记以特异性DNA片段的核苷酸变异为基础，能够直接反映出DNA水平的遗传多态性、生物个体或种群间基因组中差异的一种遗传标记技术。其优点为范围广、遗传稳定和直观准确，是动物领域遗传育种方向的一项新兴应用技术。分子标记在多个领域中都有应用，其中在标记辅助选择（Marker assisted selection，MAS）上的应用推动了育种工作的发展[1]。早期水貂的品种鉴定方法是通过水貂的品种形态学标记和生产性能测定，现今已发展到在分子水平上对水貂进行品种资源的多样性分析和相关重要经济性状的测定。分子标记在水貂品种育种方面和遗传评价的广泛应用，对我国水貂种貂繁殖、良种化及核心群体的建立具有十分重要的意义[2]。

2007年首次构建水貂简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR）遗传图谱，该图谱的建立推动水貂的分子遗传标记的发展，SSR分子标记因其多态性高、信息量大、PCR检测方便及分布在全基因组中而被广泛应用于许多遗传研究中，成为最受欢迎的分子标记之一，然而，由于缺乏有关参考基因组侧翼标记序列的信息，这些标记的可用性受到阻碍[3]。Cai Z等[4]首次公布了水貂全基因组信息，这使得应用序列基因分型（Genotyping-by-Sequencing，GBS）鉴定整个水貂基因组中的SNP成为可能。……