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一种自动化的数字病理图像质量控制方法

2021-12-02王素英张慧芝丁华新

科学技术创新 2021年32期
关键词:区域质量

王素英 张慧芝 丁华新*

(宁波市临床病理诊断中心,浙江 宁波 315000)

1 概述

近年来,使用数字扫描仪创建病理组织的切片图像(全切片数字化成像,Whole Slide Image, WSI),使病理医生的阅片可以不受显微镜的限制,极大地提高了病理教学、病例讨论等方面的效率,也使得远程会诊、开发病理人工智能等成为可能,全切片数字化成像(WSI)的使用因此越来越广泛。但是在使用过程中,也产生了一些问题,比如在载玻片的制备过程中,不可避免地会出现一些伪影(折叠、气泡、划痕、压缩等)[1]、染色不均、染色剂浓度差异和染色剂批次更换造成的差异;在载玻片的扫描过程中,不同的设备商可能采用不同的扫描方式进行载玻片的数字化,扫描仪的不同选择也可能会影响图像的质量,出现图片模糊、对比度低等情况[2]。造成差异的来源可能是不同因素或多种因素叠加,从而导致数字病理图像的呈现不同的实质性差异,这种差异制约了WSI 的临床病理应用。

从临床上看,由于制片扫片质量原因而被舍弃的载玻片在很大程度上拖累了临床病理工作流程,因为这些载玻片均需要重新制作或重新扫描,从而导致延长病理诊断的时间,造成人力、物力的浪费,也会加重病人的医疗费用[3,4]。从研究角度看,以伪影为代表的诸多噪声会对疾病检测、诊断和预后等任务的分类器的开发和验证造成不利的影响,这一点对于基于深度学习和机器学习来说尤为明显[5,6]。目前,大多数临床和研究应用的质量控制都是通过手动执行的,这使得数字图片质量控制过程主观、费时、费力且容易出错。……

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