北京市门头沟区2018-2020年急性胃肠炎患者诺如病毒基因型分析
2021-11-29刘海涛曹殿起张博文吕秋艳
刘海涛,曹殿起,张博文,吕秋艳,苏 健
(门头沟疾病预防控制中心,北京 102300)
急性胃肠炎是全球范围内的常见病,临床主要表现为大便次数增多且性状改变,可伴有发热、呕吐、腹痛,重者继发水电解质紊乱、酸碱失衡和全身中毒症状。在我国,每年患急性胃肠炎人数约8.36亿,急性胃肠炎发病率位居所有传染性疾病首位;在世界范围内,病毒是造成急性腹泻发生的主要原因,其中,诺如病毒( Norovirus, NoV)已成为最常见的肠道感染病原体之一,继轮状病毒(Rotavirus, RV) 之后,NoV已成为可引起人类病毒性急性胃肠炎的主要病原体[1]。在全球,每年因诺如病毒感染导致约6.99亿人感染和超过20万人死亡[2-3]。
自2014年冬季以来,我国诺如病毒暴发疫情大幅增加。为了解北京市门头沟区急性胃肠炎患者诺如病毒流行特征,探讨溯源关系,现对2018-2021年急性胃肠炎患者诺如病毒基因特征进行分析,为诺如病毒感染的科学防控提供依据。
1 材料与方法
1.1主要仪器与试剂 Q5型实时荧光定量PCR仪(美国Theme公司),kingfisher核酸提取仪(美国Theme公司)。诺如病毒GI群检测试剂盒、诺如病毒GⅡ群检测试剂盒(北京卓诚惠生有限公司),核酸提取试剂盒(上海医脉赛科技有限公司)。
1.2样本来源 收集2018年1月-2020年12月北京市门头沟区监测哨点医院(门头沟区区医院、京煤集团总医院)的急性胃肠炎患者粪便标本。采集标准: 急性胃肠炎病例定义是24小时内呕吐1次,或者腹泻达到3次。急性胃肠炎粪便标本放于-80 ℃保存备用。
1.3病毒核酸提取 制备10%的便悬液,取黄豆大小的粪便,用300 μl的PBS稀释,振荡混匀后1 500 r/min,离心10 min;……
