基于数据挖掘分析GALNT2基因在肺腺癌中的表达及临床意义
2021-11-26陈凯锐童华生周泉孙朝晖
陈凯锐,童华生,周泉,孙朝晖*
1南部战区总医院检验科,广州 510010;2南部战区总医院急诊科,广州 510010
肺癌是全世界癌症相关死亡人数最多的癌症,根据2018年的全球癌症统计数据,肺癌的病死人数占癌症总死亡人数的18.4%[1]。肺癌中约有85%被归类为非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),并可细分为鳞状细胞癌、肺腺癌及大细胞癌[2-3]。肺腺癌是最常见的肺癌亚类,占NSCLC的65%,占所有肺癌的40%以上[4-5]。2015年,中国新发肺癌约有78.7万例[6]。肺癌的发生发展是一个复杂、多步骤的过程,与各种基因突变、细胞信号转导通路激活及异常新生血管形成密切相关,但其分子机制仍不完全清楚[4]。通过筛选与肿瘤相关的基因网络,有可能确定肺腺癌新的药物靶标并发现用于治疗及诊断的生物标志物。糖蛋白发挥着多种生物学功能,如细胞间信息传递、细胞内信号转导及维持蛋白质稳定性[7]。黏蛋白型或N-乙酰基-D-半乳糖胺(GalNAc)型O-糖基化是由一大类多肽GalNAc-转移酶(GALNT,也称为GalNAc-T)同工酶催化的O-蛋白质的糖基化。N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(GALNT2)是GALNT家族的第2个成员[8],广泛分布于肾脏、胰腺、胃、肠等多种器官中[9]。
全基因组关联研究(GWAS)确定GALNT2参与了人类脂蛋白的代谢调控[10],其催化底物包括脂蛋白脂肪酶抑制剂类血管生成素3(ANGPTL3)、载脂蛋白C-Ⅲ(apoC-Ⅲ)[11]及磷脂转移蛋白(PLTP)等[12]。后续研究显示,该基因在多种恶性肿瘤,如胃癌、胶质瘤、肝细胞癌及口腔鳞状细胞癌中表达失调[13-15]。然而,GALNT2在肺癌尤其是肺腺癌发生、发展中的作用仍不清楚。本研究基于Oncomine数据库、UALCAN数据库、cBioportal数据库及String数据库进行数据挖掘,进而分析GALNT2基因在肺腺癌中的表达情况及其预后意义,旨在为后续研究GALNT2基因在肺腺癌发生发展中的作用奠定基础。……
