陆秋萍,季锷,蒋明义

(南京农业大学生命科学学院,江苏 南京 210095)

ZFP36属于C2H2类型的锌指蛋白,已有研究证明其作为转录因子参与植株抗氧化防护以及在水稻抗稻瘟病过程中起重要作用[1-3]。以ZFP36为诱饵进行酵母双杂交筛库试验,将得到的结果进行序列比对,发现了1个互作蛋白OsGRP1。OsGRP1是富集甘氨酸蛋白(glycine-rich protein,GRP),在植物中富含甘氨酸蛋白质的特点是存在半重复的富含甘氨酸的基序[4]。一般来说,这些基因呈现出发育调控和组织特异的表达模式[5]。在一些植物中,它们的表达也受到生物和非生物因素的调控。

植物GRP的分类是基于其一般结构,再考虑甘氨酸重复的排列以及保守基团的存在[6]。Ⅰ类GRP可能包含1个信号肽和1个高甘氨酸含量区域,有(GGX)n重复[7]。Ⅱ类GRP也可能包含1个信号肽,并含有1个特征性的富含半胱氨酸的C末端。Ⅲ类GRP可能含有1个信号肽,并且与其他类别相比,含有较低的甘氨酸含量。在这些蛋白质中,油素域是这一子群的标志性基团[8]。Ⅳ类GRP又称为RNA结合型GRP,除了富含甘氨酸的域外,它们还存在1个RNA识别基序(RRM)或1个冷休克结构域(CSD),它们的结构中还可能存在CCHC锌指结构[9]。根据不同的域排列,Ⅳ类GRP又分为Ⅳa(除富含甘氨酸域外,还含有1个RRM基团)、Ⅳb(1个RRM和1个CCHC锌指)、Ⅳc(1个冷休克域和2个或更多锌指域)和Ⅳd(2个RRM)[10-11]。此外,在桉树属基因组中还发现了1组具有高甘氨酸含量但具有混合重复模式的GRP,也存在于拟南芥和水稻基因组中,因此提出了一类新的GRP(第Ⅴ类)[12]。

根据已有研究和BLAST蛋白序列比对,我们发现OsGRP1与拟南……