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基因组Ⅰ型和Ⅴ型传染性胰脏坏死病毒的分离与鉴定

2021-11-17段凯越赵景壮任广明邵轶智卢彤岩何保全徐黎明

大连海洋大学学报 2021年5期

段凯越,赵景壮,任广明,4,邵轶智,卢彤岩, 4,何保全,徐黎明*

(1.上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306; 2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江 哈尔滨 150070; 3.上海海洋大学 农业部渔业动植物病原库,上海 201306; 4.中国水产科学研究院长江水产研究所,湖北 武汉 430223)

虹鳟Oncorhynchusmykiss是中国主要冷水鱼养殖品种,广泛分布在中国东北、西北、西南等冷水资源较发达的地区,在带动当地经济发展、促进渔民增收方面发挥了积极的作用。随着养殖规模的扩大、苗种的频繁流通,虹鳟病害频发,严重制约了冷水鱼养殖业的绿色健康发展。

传染性胰脏坏死病(infectious pancreatic necrosis,IPN)是一种全球流行性疾病,于20世纪50年代在美国开始流行[1],至今已传播到法国[2]、土耳其[3]、智利[4]、墨西哥[5]、芬兰[6]、挪威[7]、西班牙[8]、日本[9]、韩国[10]和伊朗[11]等国家,给鲑鳟鱼养殖业造成了较大的经济损失。该病是由传染性胰脏坏死病毒(infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)引起的一种病毒性疾病,主要威胁鲑科鱼类。IPNV隶属于双RNA病毒科Birnavirdate水生双RNA病毒属Aquabirnavirus,其病毒粒子无囊膜包裹,呈二十面体。IPNV的基因组由A和B两条RNA组成。A链包含两个重叠的开放阅读框(open reading frame,ORF),其中较大的ORF编码外衣壳蛋白VP2、内衣壳蛋白VP3和蛋白酶VP4,小ORF编码非结构多肽VP5[12-13]。B链编码RNA依赖性RNA聚合酶VP1,用于转录和复制病毒基因组[14-15]。利用交叉中和测定法可将水生双RNA病毒分为A和B两个血清群(serogroup)[16],其中,血清群A包含9种血清型,即A1(West Buxton,WB)、A2(Spajarup,Sp)、A3(Abild,Ab)、A4(Hecht,He)、A5(Tellina,Te)、A6(Canada 1,C1)、A7(Canada 2,C2)、A8(Canada 3,C3)和A9(Jasper,Ja)[17],血清群B仅具有血清型B1。利用系统发育分析方法,可将水生双RNA病毒分为7个基因型,包括基因组Ⅰ~Ⅶ(genogroup Ⅰ~Ⅶ)。目前IPNV基因型主要分布在基因组Ⅰ~Ⅵ[18]。……

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