基于SLAF-BSA技术的蝴蝶兰花底色关联SNP分子标记开发与验证
2021-11-09肖文芳陈和明吕复兵
中国农业大学学报 2021年9期
肖文芳 李 佐 陈和明 吕复兵
(广东省农业科学院 环境园艺研究所/广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室,广州 510640)
蝴蝶兰属(Phalaenopsis)为兰科商品化程度最高的属,具极高的观赏价值和商业价值,是全球最重要的观赏花卉之一。花色是观赏花卉最重要的性状评价指标之一,直接影响其观赏价值和商业价值[1]。有别于绝大多数观赏花卉的单色花和少数复色花,蝴蝶兰的花瓣和萼片具丰富的颜色分布类型,除匀色花外,绝大多数种质资源的花瓣和萼片为双色,可分为底色和斑色,一般底色为整朵花的主色,斑色的颜色分布类型则包括阴影、镶边、条纹、线纹、网纹、斑点、斑块、阴影和镶边、线纹和斑点、镶边和线纹、镶边与线纹和斑点[2]。植物花色属于复杂的数量性状,受多基因控制,遗传基础复杂[3]。蝴蝶兰原生种众多,商品品种经过一百多年的杂交选育,血统复杂,与原生种参考基因组的比对效率极低,且花色调控机制极为精细,通过转录组和简化基因组测序挖掘性状相关基因和关联分子标记仍然是目前研究商品品种花色遗传机制的重要手段[1,4],但尚未开发出花色相关分子标记。
特异位点扩增片段测序(Specific-locus amplified fragment sequencing,SLAF)是一种根据物种个性化设计方案的简化基因组测序技术,能够获取全基因组范围内的多态性标签并快速准确筛选性状关联单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)。群分法(Bulked segregant analysis,BSA)与SLAF的结合,能够进一步加快对复杂性状定位的速度,目前已在水稻黄叶转绿基……
登录APP查看全文
