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苍耳子治疗过敏性鼻炎的分子机制研究

2021-10-27王玉洁季绍威邓泽坤

转化医学杂志 2021年5期
关键词:数据库

王 康,孟 泳,王玉洁,季绍威,邓泽坤

过敏性鼻炎(Allergic rhinitis)又称变应性鼻炎,普遍认为其是以IgE 介导的I 型变态反应。临床症状为阵发性喷嚏、清水样涕、鼻塞、鼻痒等,严重影响患者的睡眠及生活质量。据流行病学显示,全球约有10%~40%的人口患有此病[1]。在我国,过敏性鼻炎患病率达10%以上,近几年呈上升趋势[2]。长期的临床观察发现,过敏性鼻炎控制不当,易诱发支气管哮喘。

苍耳子为菊科植物,性味辛、苦、温,具有散风寒、通鼻窍的功效,是治疗鼻鼽的良药,临床应用广泛。在对治疗鼻部疾病的常用方剂统计发现[3],含有苍耳子的方剂占比约80%。经动物实验证实[4],含苍耳子正丁醇的滴鼻剂和苍耳油对变应性鼻炎有较好的治疗作用,但其具体作用机制不明。网络药理学是中医药研究的新途径,不但能揭示中药对机体的网络调控,也能为新药的研发提供方向,节约成本[5]。为了更好地阐述苍耳子治疗疾病的分子机制,本研究将借助网络药理学对此进行探讨。

1 材料和方法

1.1 数据库及软件 本研究所涉及的数据库:中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)(https://tcmspw.com/tcmsp.php),有机小分子生物活性数据库(PubChem)(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)(https://omim.org/),基因组注释数据库平台(GeneCards)(https://www.genecards.org/),基因与疾病关联数据库(DisGeNET)(https://www.disgenet.org/),全球蛋白资源数据库(Uniprot)(https://www.uniprot.org/),蛋白质相互作用关系网络数据库(String)(https://string‑db.org/),蛋白质结构数据库(prorein data bank,PDB)(https://www.rcsb.org/),生物信息学开源软件平台(Bioconductor)(http://www.bioconductor.org/)。软件:R 语言(V4.1.1)(https://www.r‑project.org/),Cytoscape(V3.7.0)(https://cytoscape.org/),PyMOL(V2.1.1)(https://pymol.org/),iGemdock(V2.1)(http://gemdock.life.nctu.edu.tw),AutoDock Tools(V1.5.6)(http://autodock.scripps.edu/)。

1.2 中药苍耳子化学成分收集及靶点预测 借助TCMSP 平台查找苍耳子的化学成分,以口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30%以及药物相似性(drug‑likeness,DL)≥0.18 为条件进行筛选,获取药物的有效活性成分。……

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