APP下载

基于转录组数据分析药用大黄的密码子使用偏好性

2021-10-25高梦琦邹建珍霍小位李依民张明英刘蒙蒙

中草药 2021年20期
关键词:分析研究

高梦琦,邹建珍,霍小位,李依民,张明英,高 静,张 岗*,刘蒙蒙*

1.河北大学中医学院,河北 保定 071002

2.河北大学药学院,河北 保定 071002

3.陕西中医药大学药学院 陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心,陕西 西安 712046

药用大黄Rheum officinaleBaill.属于蓼科大黄属多年生草本植物,为《中国药典》2020年版收录的大黄3种基原植物之一,具有泻下攻积、清热泻火、凉血解毒、逐瘀通经、利湿退黄等功效[1]。现代中药化学研究表明大黄中主要含有蒽醌类、酚类等物质,其中蒽醌类化合物是主要的活性物质,具有抗炎、抗肿瘤作用[2-3]。目前药用大黄的资源主要来源于人工种植,随着过度采挖,野生资源已经濒临灭绝。因此,开展蒽醌类化合物生物合成机制研究,探索蒽醌类化合物生物合成路径,是解决药用大黄野生资源濒危的思路之一。

遗传密码子是生物体DNA与蛋白之间信息传递的信息载体。大多数氨基酸不仅由一种密码子编码,而是可以同时由2~3种密码子编码,生物对于不同的密码子的使用具有一定偏好性[4]。研究发现,密码子使用偏好性受到GC含量(鸟嘌呤和胞嘧啶含量)[5]、基因表达水平[6]、环境压力[7]、突变压力[8]、基因长度[9]、蛋白结构[10]及tRNA丰度[11]的影响。随着高通量测序技术的发展,药用植物的密码子使用偏好性研究有了显著的成果[12-13],但是目前还没有关于药用大黄密码子偏好性的研究。生物体选择最优密码子可以体高基因的翻译效率及蛋白的表达量。因此,研究密码子的使用偏好性,有利于基因工程研究中密码子优化、最适外源宿主选择,并对生物的系统进化研究具有重要意义。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

分析研究
FMS与YBT相关性的实证研究
2020年国内翻译研究述评
辽代千人邑研究述论
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
视错觉在平面设计中的应用与研究
EMA伺服控制系统研究
电力系统不平衡分析
新版C-NCAP侧面碰撞假人损伤研究
电力系统及其自动化发展趋势分析
中西医结合治疗抑郁症100例分析