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肝细胞肝癌中CENPF的表达及临床意义

2021-10-12黄育刚汤显斌

临床与实验病理学杂志 2021年9期
关键词:肝癌数据库分析

李 丹,黄育刚,汤显斌

肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是常见的原发性恶性肝肿瘤之一,约占肝肿瘤的80%[1]。在我国HCC引起的肿瘤相关病死率位居第三,仅次于肺癌和胃癌[2],其5年生存率低于18%[3-4]。CENPF(Centromeric protein F)是细胞周期相关的核抗原。研究表明,CENPF在肝癌[5]、乳腺癌[6]、前列腺癌[7-8]等多种人类恶性肿瘤中存在异常表达。虽然关于CENPF在HCC中的表达情况已有报道[9],但其生物学过程和分子机制等尚不清楚。本实验结合HCC临床样本及肿瘤基因数据库,对CENPF表达与患者预后的相关性、潜在信号通路进行探讨,以期为HCC的早期诊断、预后评估和抗肿瘤治疗提供参考。

1 材料与方法

1.1 数据提取运用GEO数据库、TCGA和Oncomine平台筛选与HCC相关的数据集。在GEO数据库中,包含人HCC及其邻近或正常肝组织,且病例数200以上的,共筛选到2个数据集,即GSE14520和GSE25097。基于TCGA、Oncomine平台中HCC相关信息,分析CENPF在HCC及正常肺组织中的表达差异、与临床分期及病理分级的相关性。此外,应用GEPIA平台分析CENPF与HCC患者预后的关系。

基于TCGA数据库,用SPSS 25.0软件进行CENPF表达与年龄、性别、临床分期、病理分级等临床参数的相关性分析;应用GSEA 4.0.3软件进行基因集富集分析,在HCC中,探索与CENPF基因表达可能相关的KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、Hallmark和Biocarta信号通路。

1.2 材料收集2019年12月~2020年12月十堰市太和医院病理科存档的HCC及对应癌旁正常组织,选取有完整病历及临床信息全面的样本,合计18例;所有病例均未行放、化疗,所有病理指标均经过两位病理医师重新评定,并达成一致的意见。

1.3 免疫组化对18例HCC及癌旁正常组织,各取3 μm厚组织切片,用EDTA(pH 9.0)进行热修复,玻片与CENPF抗体(英国Abcam公司,稀释浓度1 ∶400)在37 ℃孵育1 h,再用辣根过氧化物酶标记的二抗(福州迈新公司,货号KIT5230)37 ℃孵育0.5 h,苏木精复染30 s。……

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