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基于生物信息学分析卵巢癌免疫细胞浸润程度及其与预后的关系

2021-09-16苑雪萍韩旭东

国际检验医学杂志 2021年17期

熊 璐,苑雪萍,徐 冲,许 琳,韩旭东

北京市中关村医院病理科,北京 100190

卵巢癌是严重威胁妇女健康的恶性肿瘤。尽管近年来卵巢癌的手术和化学疗法取得了较大进步,但是其发病率和病死率仍呈逐年上升的趋势。全世界每年新诊断出超过23万例患者和超过15万名女性死于卵巢癌[1-3],卵巢癌患者的5年存活率仅为47%[4]。关于卵巢癌的治疗,肿瘤细胞减灭手术和化疗药物铂类、紫杉醇等治疗是晚期卵巢癌患者的一线疗法。这种标准治疗方案在晚期卵巢癌中的完全反应率可达40%~60%,但是在18个月后复发的患者超过了90%,并且出现对化疗药物耐药,最终死于卵巢癌[5]。由此可见,卵巢癌的预后仍有待进一步提高,探索新的治疗靶点和手段是十分必要的。

随着肿瘤免疫治疗的进展,肿瘤与免疫的相关性受到越来越多的重视,肿瘤中浸润的免疫细胞水平与肿瘤生长、进展和患者结局有关,成为近年研究的焦点[6-7]。从免疫学角度看,卵巢癌患者紊乱的免疫功能在肿瘤细胞的发生、发展中起着重要作用[8-9]。有学者提出了从复杂组织的基因表达谱中计算免疫细胞组成的方法,该方法在结直肠癌、肺癌、滤泡淋巴瘤中通过流式细胞术得到很好的验证,能大规模应用于基因表达谱数据的分析[10-11]。本研究利用GEO数据库中卵巢癌的表达谱数据,通过R软件计算了卵巢癌样本中免疫细胞的组成,并进一步分析了免疫细胞浸润与卵巢癌预后的关系。

1 资料与方法

1.1数据来源 本研究的卵巢癌芯片数据来源于GEO数据库的GSE63885数据集,GSE63885数据集中包含101例卵巢癌患者的组织RNA-seq测序数据(由GPL570平台注释)。……

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