胃癌免疫相关LncRNA预后风险模型的建立与分析
2021-09-14刘革新刘盼陈维顺
刘革新,刘盼,陈维顺
胃癌是消化系统常见的恶性肿瘤之一,具有高发病率和高死亡率。世界卫生组织GLOBOCAN数据显示:2018年全球新诊断病例约100万例,其中死亡病例约72万例,是死亡第三大疾病[1]。在我国胃癌是常见的第二大肿瘤,其死亡率居恶性肿瘤的第二位[2,3]。外科手术治疗仍是胃癌的一线治疗方案,尽管目前对于胃癌的治疗包括手术治疗、放疗、化疗和新辅助治疗等多学科综合治疗,但是由于胃癌早期临床症状不明显,大多数患者确诊时已处于晚期,其预后仍然很差[4]。早期检测、研究新的治疗靶点以及有效预测胃癌患者的预后是改善胃癌治疗和预后的重要手段。因此,探索胃癌早期诊断和预后的新型生物标志物对于其临床治疗具有重要意义。
长非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)是指具有200多个核苷酸的转录本,不参与蛋白质的编码[5]。研究证实LncRNA参与多种生物学过程的调控,包括从转录到蛋白质定位和稳定等多个基因表达过程[6,7]。近年来研究发现,在肿瘤中LncRNA发挥重要的调控作用,包括肿瘤的发生、发展、侵袭、转移等,为肿瘤的诊治方案及预后的预测评估提供指导[8,9]。既往研究发现多种LncRNA如NEAT1、AC097478.3、AC097478.1、AL354719.2在胃癌中出现异常表达,并且与胃癌的发生发展密切相关,是胃癌的潜在诊断及预后生物标志物[10-11]。最近,在胃癌中也有基于LncRNA预后模型的构建,并证实与胃癌预后显著相关[10],但免疫相关LncRNA与胃癌生存预后的关系尚无研究报道。
本研究从肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库中下载胃癌样本转录组数据和临床信息,筛选免疫相关LncRNA,分析免疫相关LncRNA在胃癌中的表达及其与预后的关系,筛选预后相关免疫LncRNA建立预后风险模型,并结合临床信息进行预后危险因素评估。……
