基于网络药理学联合GEO芯片探讨肠安泻愈汤在肠易激综合征亚型中的分子机制
2021-09-13张强喻斌阳力
张强,喻斌,阳力
肠易激综合征[1](irritable bowel syndrome,IBS)是临床常见胃肠功能紊乱疾病,以间歇或持续发作腹部不适、腹胀腹泻、便秘、排便困难为主要症状,临床根据患者大便性状可分为腹泻型、便秘型、混合型与不定型4种类型,临床以腹泻型(Diarrhoea-predominant IBS,IBS-D)和便秘型(Constipation-predominant IBS,IBS-C)为多见,IBS-D占62.3%,IBS-C占12%[2]。IBS属中医“腹泻”、“便秘”、“郁病”等范畴,以脾胃为本,病位大肠,与肝密切相关[3]。肠安泻愈汤是湖南中医药大学第一附属医院消化内科治疗IBS的临床经验方,由柴胡12 g,党参20 g,枳实10 g,茯苓15 g,白术10 g,白芍20 g,紫菀10 g,紫苏子10 g,泽泻10 g,薏苡仁10 g组成,随症加减,结合了肝郁脾虚病机,以疏肝健脾兼以宣肺为治则,前期研究发现具有较好的临床疗效和明显的优势[4]。
基因综合表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)是NCBI子数据库,收集了各种表达、测序、甲基化等芯片数据,对芯片进行差异分析能筛选出疾病、敲入、敲除等特定变量环境下的差异表达基因。网络药理学是中医药研究的新方法,综合多种中药有效成分及靶点数据库,对中药复方聚焦分析能获取中药复方的作用靶点及其网络化调控机制。为进一步揭示肠安泻愈汤在IBS中的作用及其在IBS-D、IBS-C亚型中的分子机制,本研究采用网络药理学联合GEO差异分析的方法,对肠安泻愈汤在IBS亚型中的靶点、通路、miRNA等分子机制进行生物信息学的探讨,为临床及实验验证提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 肠易激综合征亚型差异基因筛选及疾病基因获取
通过NCBI基因表达GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库,以“Irritable Bowel Syndrome”为检索词,获取GSE36701数据IBS亚型(IBS-D、IBS-C)表达矩阵文件,其中包括HV(healthy volunteers,HV)、IBS-D、IBS-C患者的单样本数据。……
