树突细胞免疫应答结核分枝杆菌基因调控网络的构建与分析
2021-09-11孙海明徐广宇
北华大学学报(自然科学版) 2021年4期
林 妍,孙海明,徐广宇
(1.北华大学基础医学院,吉林 吉林 132013;2.北华大学药学院,吉林 吉林 132013)
结核病(Tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,M.tb)引起的主要致命传染病,2019年全球约有1 000万人感染结核病[1].先天免疫应答在预防结核病发展中起着至关重要的作用,巨噬细胞和DCs可以感知结核分枝杆菌的存在,是最初被感染的细胞,这些细胞分泌介质,产生炎症信号,通过驱动T淋巴细胞的激活和分化清除感染效应[2-3].结核分枝杆菌除能破坏巨噬细胞的防御机制,还能干扰DCs的功能,DCs是宿主免疫系统的主要抗原呈递细胞,在连接先天免疫和适应性免疫过程中具有核心作用.在被结核分枝杆菌感染后,DCs从肺部迁移到引流淋巴结,在淋巴结向T淋巴细胞呈递抗原,协调抗细菌感染的免疫过程并最终决定疾病的结局[4-5].而在DCs应答结核分枝杆菌感染过程中,宿主基因表达的变化可以影响其庞大的基因调控网络,进而调节宿主免疫应答相关的进程与通路.因此,系统地、深入地挖掘DCs免疫应答结核分枝杆菌致病机制及宿主感染免疫机制具有重要意义.
本研究通过收集NCBI GEO datasets数据库中结核分枝杆菌感染DCs模型的芯片表达谱数据(感染组130例,对照组129例),筛选出感染组相对于对照组DCs中表达差异的基因,初步构建了结核分枝杆菌感染DCs中异常表达的基因调控网络(Gene regulatory network),以筛选可能在结核分枝杆菌感染宿主DCs中存在的重要分子调控模块,挖掘DCs向T淋巴细胞呈递抗原过程中协调抗细菌免疫的显著……
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