张奕杰

(首都医科大学附属北京天坛医院呼吸与危重症医学科， 北京 100070)

结核病是由MTB复合群感染引起的慢性传染病，不仅是世界十大致死原因之一，也是最致命的传染病，随着多耐药、广泛耐药及全耐药结核的日益增多，使得结核病的治疗难度不断增加，因此对于MTB的及时诊断、传播致病及耐药机制研究就显得尤为重要[1]。应用二代测序能够鉴定结核与非结核分枝杆菌(NTM)以及检测耐药基因，可从基因组水平进行深入研究耐药、毒力、致病机制。宏基因组学(metagenomics)是指直接从人类组织活检和体液样本中检测出微生物组总DNA或RNA，分析全部微生物组成，基于二代测序的宏基因组学，简称mNGS。随着测序流程优化，成本降低，目前周期可缩短至24h以内，可实现临床快速诊断及精准治疗，使得患者获益，因此本文结合国内外文献以及我院4例应用mNGS技术诊断结核菌感染病例，对其应用价值进行讨论。

1 资料与方法

1.1一般资料:选取由首都医科大学附属北京天坛医院呼吸与危重症科收治的4例应用mNGS技术作为重要临床诊断依据确诊为结核感染的患者作为病例资料，确诊结核感染标准：上述送检标本MTB培养阳性、涂片阳性、病理诊断为结核感染、mNGS检测阳性等4项中至少1项符合即可确诊。当至少1条read比对到种或复合群水平时，结果被认为是MTB阳性。

1.2方法:以“二代测序”或“NGS”和“结核”作为关键词，在万方数据库和中国知网数据库对2021年1月以前的中文文献进行检索，在PubMed数据库以“NGS，tuberculosis”为关键词检索2021年12月以前的英文文献，共154篇，排除会议、报纸、综述，以文章提供了mNGS、传统方法、Xpert结果为纳入标准，最后共有453例确诊或临床诊断为MTB感染的临床资料纳入本研究。……