不同发育时期大头金蝇蛹转录组测序分析
2021-08-20王启燕张红玲任峥刘玉波季晶焱黄江
法医学杂志 2021年3期
王启燕,张红玲,任峥,刘玉波,季晶焱,黄江
贵州医科大学法医学院 法医司法鉴定中心,贵州 贵阳550004
死亡时间推断是法医工作者首要解决的问题,利用案发现场昆虫推断死亡时间的主要依据是在一定环境条件下昆虫发育到某一特定阶段所需时间相对恒定,各种形态或生理特征变化有一定的规律性,根据该种昆虫所处的发育阶段可以推断其经历的发育时间,进而为死亡时间推断提供比较可靠的线索[1]。
转录组是指生物体的细胞或组织在一个特定状态下转录出来的所有RNA 的总和,包括信使RNA 和非编码RNA,转录组测序能够提供全部基因的表达信息和蛋白质的功能、相互作用的信息。昆虫转录组研究提供了一种快速、高通量、全面解读昆虫基因组信息的全新技术手段,为更全面、更深入地研究昆虫生命活动中相关基因功能、系统发生与进化、生长发育以及昆虫与其他生物相互作用等提供依据[2]。
大头金蝇是常见的嗜尸性蝇类,精确推断蛹的发育历期,对于推断死亡时间具有重要参考价值。为更好地了解大头金蝇蛹的转录组情况,挖掘更多与法医学相关的信息,本研究对收集到的6 个发育时期(6 d)的大头金蝇蛹进行转录组测序,通过差异基因的聚类模式分析、富集分析等方法,为深入分析大头金蝇蛹的发育调控、表观调控、环境适应以及法医学应用等问题奠定基础。
1 材料与方法
1.1 大头金蝇蛹的采集
以新鲜猪肺作诱饵,采用扣捕法采集成虫于夏季,经法医昆虫学专家参照《中国尸食性蝇类》[3]进行鉴定;……
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