转录组测序分析高尔基体蛋白73参与调控肝癌的作用机制
2021-08-17叶佩灵嘉红云
叶佩灵, 嘉红云, 彭 亮
1 广州医科大学附属第二医院 检验科, 广州 510260; 2 广州医科大学附属第五医院 检验科, 广州 510700
在我国,肝癌是仅次于肺癌的第二大恶性肿瘤,中国占全球发病人数的47%[1]。肝癌的发病原因尚未明确,以发展快、疗效差和复发率高为特征,极易发生肝内和肝外转移,预后差,5年生存率不足30%。近年来,大量研究发现高尔基体磷蛋白2/高尔基体蛋白73(golgi phosphoprotein 2,GOLPH2/GP73)的高表达与肝脏疾病有一定的关系[2-3],尤其与原发性肝癌关系密切,人们逐渐认识到GP73有可能成为肝癌早期诊断的标志物[4-5],血清GP73可预测肝细胞癌患者肝切除术后的预后[6]。研究[7]还发现,有效干扰GP73基因表达后,可明显抑制人肝癌细胞的迁移和侵袭能力,GP73的表达可能与肿瘤的发生发展相关。目前关于GP73通过何种信号通路参与肝癌的发生发展的研究较少,为进一步阐明GP73对肝癌的作用机制,本实验建立了干扰和过表达GP73的Hep3B肝癌细胞模型,采用转录组测序检测不同GP73表达量的肝癌细胞中mRNA表达谱的差异,并进行生物信息学分析,旨在筛选出GP73参与调控肝癌相关的信号通路,进而为肝癌发病机制的探索提供新的思路。
1 材料与方法
1.1 试剂和仪器 Hep3B细胞株购于广州赛库生物技术有限公司;GP73、GAPDH一抗购于Proteintech公司;PI3K、p-AKT和AKT抗体购于CST公司;pcDNA3.1过表达质粒、阴性对照质粒由安徽通用生物科技有限公司提供;干扰片段引物设计、合成和测序由吉玛生物公司完成;文库构建试剂盒(NGS00-2013,中国依科赛);Trizol(TR118-500,MRC);qRT-PCR试剂盒(Q341-03,Vazyme),GP73、内参GAPDH引物、实时定量PCR引物由捷瑞生物公司合成。……
