胃肠间质瘤c-kit、血小板源性生长因子受体A基因外显子突变谱与临床病理学特征分析
2021-08-07符德元
石 磊, 陈 平, 王 昊, 赵 伟, 符德元
(江苏省苏北人民医院/扬州大学临床医学院, 1. 胃肠外科, 2. 甲乳外科, 江苏 扬州, 225001)
胃肠间质瘤(GIST)是胃肠道最常见的间叶源性肿瘤,显示Cajal间质细胞分化,大多数患者具有c-kit或血小板源性生长因子受体A(PDGFRA)功能获得性突变[1]。《中国胃肠间质瘤诊断治疗共识(2017年版)》[2]推荐疑难病例、拟行靶向治疗(包括术前治疗、辅助治疗和晚期GIST靶向治疗)、野生型、继发耐药GIST患者行常规基因检测。基因检测对评估GIST患者预后以及分子靶向治疗反应性均有指导意义。本研究分析GIST中c-kit、PDGFRA基因的突变类型及特点,探讨其与GIST临床病理学特征的关系,旨在为GIST患者的全程化管理提供参考。
1 资料与方法
1.1 一般资料
收集江苏省苏北人民医院2013年1月—2020年12月收治的288例经临床诊断、病理检查确诊为GIST且具有完整临床病理学资料、基因突变信息的患者信息。临床病理学资料包括性别、年龄、肿瘤原发部位、肿瘤最大径、核分裂象计数、改良美国国立卫生研究院(NIH)危险分级和CD117、CD34和DOG-1表达情况等。基因突变信息包括c-kit基因外显子9、外显子11、外显子13、外显子17和PDGFRA基因外显子12、外显子18的突变情况。
1.2 Sanger基因测序
选择合适的肿瘤组织石蜡包埋切片5张,勾选肿瘤细胞比例在60%以上的肿瘤组织区域并行刮取、富集肿瘤细胞,苏木精-伊红(HE)染色结果见图1。提取DNA,测定DNA浓度和纯度,进行聚合酶链式反应扩增。采用双向Sanger测序检测c-kit基因外显子9、外显子11、外显子13、外显子17及PDGFRA基因外显子12、外显子18突变,测序引物见表1。对于DNA碎片严重的标本,可针对性地设计短片段引物测序。……
