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特异位点DNA甲基化常用检测技术及应用进展

2021-08-07姚燕丽黄宇哲韩芝斌曹春玲吴静标

分子诊断与治疗杂志 2021年7期
关键词:检测

姚燕丽 黄宇哲 韩芝斌 曹春玲 吴静标

DNA 甲基化是表观遗传学领域研究的重点之一[1]。DNA 甲基化是指在DNA 甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的作用下,基因组DNA 序列上CpG 岛的二核苷酸5′端胞嘧啶转变为5′甲基胞嘧啶。DNA 的异常甲基化通常发生在肿瘤的超早期,是肿瘤生长的“种子”因素[2]。CpG 存在两种形式,一种为分散型的中高度重复序列;另一种为高度聚集,形成CpG 岛[3]。CpG 岛中的CpG 一般是非甲基化状态,其异常甲基化与肿瘤息息相关。甲基化一般都是连续发生的,即某一CpG 位点发生甲基化,那么该位点上下游一定区域内的CpG 也发生甲基化。研究表明,基因组启动子区甲基化,会改变重要遗传基因表达,是导致癌症发生的原因之一[3]。随着癌症进程改变,甲基化也会动态改变。此外,不同肿瘤的甲基化图谱也存在明显的差异。综上,利用甲基化检测对肿瘤进行早期筛查具有很大应用潜力[4]。循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA),属于血液循环游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的一种,作为近年来肿瘤领域检测的研究重点,在肿瘤无创前期早筛中具有重要应用价值。本文将综述甲基化的各检测技术,对DNA 甲基化的临床应用情况进行总结,分析相关产品目前存在的技术难点及未来发展趋势。

1 特异位点甲基化检测方法

有效的甲基化基因检测手段是应用的关键。近年来,市面上出现了不少DNA 甲基化的检测技术,发展已达十几种[5-6],按照技术类型,分为甲基化特异性扩增技术[如甲基化特异性PCR、甲基化特异性半巢式/巢式PCR、甲基化敏感性限制性内切酶……

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