孙楠 曲守方 陈样宜 高飞 张文新 于婷★ 黄杰★

随着检测技术发展，高通量测序技术已经在临床被广泛应用于遗传和肿瘤检测领域，如无创产前基因检测（NIPT）、胚胎植入前遗传学筛查与诊断（PGS/PGD）、遗传病筛查与诊断、肿瘤诊断与治疗等［1-4］。目前商业上常用的二代测序平台根据测序原理可分为光学技术（Illumina 公司和华大基因公司为代表）和半导体技术（Thermo 公司为代表）［5-6］。每个测序平台都有各自的特异性参数，包括仪器大小、通量、读长、运行时间及测序成本等，应结合具体的临床应用需求选择合适的测序平台进行评估［7］。不同测序平台之间存在显著的系统性差异，对测序平台性能进行综合评估能够有效规范临床应用平台的使用和应用开发。为实现对第二代测序仪器性能评估，中国食品药品检定研究院研制了测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品，也制定了高通量基因测序仪行业标准。本研究按照制定的高通量基因测序仪行业标准的性能指标的要求，使用测序通量＜20 Gb/run 且≥2 Gb/run 高通量基因测序仪进行验证，评价该标准的可行性。

1 材料与方法

1.1 试剂与仪器

测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品，包括四种基因组DNA 样本，分别是人基因组DNA 样本（Human_1～3）、大肠杆菌基因组DNA 样本（Ecoli_1～3）、高GC 含量细菌基因组DNA 样本（Olsenella_1～3）、人乳头瘤病毒11 型基因组DNA样本（HPV11_1～3），中国食品药品检定研究院（简称中检院）提供。

文库构建试剂盒、测序反应通用试剂盒（半导体法）和BioelectronSeq 4000 基因测序仪，东莞博奥木华基因科技有限公司提供。……